RNA–Protein interactions for RNA: YJL113W

YJL113W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YJL113W, Length 4,647 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL113WYJL113W SLM2P53955 656 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W NNT1Q05874 261 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YLR162WQ06235 118 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W APC9Q12107 265 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W EMC6Q12431 108 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YCL021W-AQ96VH3 125 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W HBS1P32769 611 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RRN10P38204 145 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W INM1P38710 295 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SMF1P38925 575 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W AIM2P39721 246 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W AGX1P43567 385 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W NIT2P47016 307 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ABM1P47146 123 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YNL095CP53932 642 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DCI1Q08558 271 aa-0.55□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ARG3P05150 338 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CYC3P06182 269 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CLB2P24869 491 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPB7P34087 171 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W LAG1P38703 411 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W IPT1P38954 527 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SRP14P38985 146 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PHO90P39535 881 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SWP82P43554 623 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PMT3P47190 753 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W AVT4P50944 713 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YNL143CP53908 130 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RMI1Q02685 241 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ABZ2Q03266 374 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RCE1Q03530 315 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W VPS38Q05919 439 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RAF1Q06891 181 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RRT8Q08219 342 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DCN1Q12395 269 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YHR032W-AP0C5N6 59 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RBK1P25332 333 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YKT6P36015 200 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.56□□□□□ -2.5not detected
YJL113WYJL113W YBR016WP38216 128 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W UFE1P41834 346 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W IMD3P50095 523 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CPD1P53314 239 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ACT1P60010 375 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W OST6Q03723 332 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W COX20Q04935 205 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W IRC23Q08416 157 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YOR385WQ08909 290 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YPL191CQ08930 360 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W POM34Q12445 299 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W KRE1P17260 313 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FAR1P21268 830 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W HSP30P25619 332 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W OCH1P31755 480 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SLM6P38343 150 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MLH1P38920 769 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TPA1P40032 644 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RIO2P40160 425 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W REE1P40893 198 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YSA1Q01976 231 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RCF1Q03713 159 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YKU80Q04437 629 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SPG4Q04438 115 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W HUT1Q12520 339 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YOR192C-CQ3E736 78 aa-0.56□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W COR1P07256 457 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W BCY1P07278 416 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FUS3P16892 353 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W EMP24P32803 203 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YOR062CP36025 268 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W COX14P39103 70 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RRT13P40042 185 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W GET2P40056 285 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SAS2P40963 338 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CUP9P41817 306 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W XPT1P47165 209 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ESF2P53743 316 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SRL4Q03085 281 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SDC1Q03323 175 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W HOR7Q05827 59 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W STE23Q06010 1027 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YLR446WQ06204 433 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ASA1Q06822 443 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MIM1Q08176 113 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FCY1Q12178 158 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MATALPHA1P0CY06 175 aa-0.57□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W HMLALPHA1P0CY07 175 aa-0.57□□□□□ -2.5
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