RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W ADK1P07170 222 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W MTC7P32633 139 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W SNC2P33328 115 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W AST1P35183 429 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W SLM4P38247 162 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W PRS2P38620 318 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W SOL3P38858 249 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W FMC1P40491 155 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YFL015CP43578 164 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YJR056CP47115 236 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W ATG40Q99325 256 aa7.25□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W PET122P10355 254 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W MRP1P10662 321 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W FAR1P21268 830 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W CPR5P35176 225 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W MRPL36P36531 177 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YFL054CP43549 646 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W EFM3P47163 339 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W GRX5Q02784 150 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W MIX17Q03667 156 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W DAL4Q04895 635 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W FCY1Q12178 158 aa7.24□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W PEX4P29340 183 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W FUN26P31381 517 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W COQ2P32378 372 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W MTC2P34246 357 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W EDS1P38073 919 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W DUO1P53168 247 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W HSK3P69852 69 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W STD1Q02794 444 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YLR283WQ05867 314 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W HEM25Q07534 307 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W ATO3Q12359 275 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W LAS17Q12446 633 aa7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W ADE8P04161 214 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W HEM13P11353 328 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YCR101CP25607 182 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W PMU1P36069 295 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W PAU24P38155 120 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YLF2P38746 405 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W NOP16P40007 231 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W SRL4Q03085 281 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YMR252CQ04814 134 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W ORT1Q12375 292 aa7.22□□□□□ -1.25
CPD1YGR247W YLR358CO13565 187 aa7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W INO2P26798 304 aa7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W VMA6P32366 345 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W CCS1P40202 249 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W BUD8P41698 603 aa7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W MID1P41821 548 aa7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YGL262WP53054 175 aa7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W SCW4P53334 386 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W HLR1Q04429 423 aa7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YKL063CP35725 167 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W UMP1P38293 148 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YIP1P53039 248 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W ERP6P53198 216 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YGR151CP53287 111 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YNL234WP53857 426 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W NEJ1Q06148 342 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W ASR1Q06834 288 aa7.2□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W RNA14P25298 677 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W FLO5P38894 1075 aa7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YJR120WP47157 116 aa7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W HOF1Q05080 669 aa7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W ATG17Q06410 417 aa7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W MDM36Q06820 579 aa7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W FRE5Q08908 694 aa7.19□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W CNE1P27825 502 aa7.18□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W SFK1P35735 353 aa7.18□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YHR212W-AP0CX91 67 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W OLE1P21147 510 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YCR061WP25639 631 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W ERG2P32352 222 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W PAU2P32612 120 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YBR144CP34215 104 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YBR285WP38354 144 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W EGD2P38879 174 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W PAM16P42949 149 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W VPS55P47111 140 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W VMA10P48836 114 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W HNT2P49775 206 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W HOR7Q05827 59 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W YDL086WQ07505 273 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W TAF3Q12297 353 aa7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CPD1YGR247W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data7.16□□□□□ -1.26not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 129 ms