RNA–Protein interactions for RNA: YGL171W

ROK1, Transcript of RNA-dependent ATPase, yeast

Gene ROK1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROK1	YGL171W	LCB3	P47013	409 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	COS6	P53344	381 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	PIR3	Q03180	325 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YML018C	Q03730	393 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YET2	Q04210	160 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RAD50	P12753	1312 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	HEM4	P06174	275 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MRS1	P07266	363 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	ARO7	P32178	256 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	OAC1	P32332	324 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	TCA17	P32613	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	PAN6	P40459	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	BXI1	P48558	297 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	TPC1	P53257	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	TDA1	Q03533	586 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	DYN3	Q04949	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	GCN3	P14741	305 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	SEC22	P22214	214 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	TRX3	P25372	127 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	ATG15	P25641	520 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MRP21	P38175	177 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YGR201C	P42936	225 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	CPR7	P47103	393 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	NRM1	P53718	249 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	AIM34	Q03673	198 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YPD1	Q07688	167 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	ERV2	Q12284	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	SWI1	P09547	1314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YCR023C	P25351	611 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	FUN26	P31381	517 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	GPX1	P36014	167 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	CHL4	P38907	458 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	HEM14	P40012	539 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	AZF1	P41696	914 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MOB2	P43563	287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	SNX4	P47057	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	COG7	P53195	279 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	FAR10	Q06001	478 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	EAF3	Q12432	401 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	COS2	P0CX12	379 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	COS3	P0CX13	379 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	CDC43	P18898	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	HOT13	P36078	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	SLM6	P38343	150 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	ECM14	P38836	430 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	SDC1	Q03323	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MIM1	Q08176	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	HRT3	Q12347	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RPN13	O13563	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	STE7	P06784	515 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MDM10	P18409	493 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MIX23	P38162	196 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	MBA1	P38300	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YHL049C	P38722	271 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	NVJ1	P38881	321 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	SHY1	P53266	389 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	CRZ1	P53968	678 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	PET191	Q02772	108 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	BBP1	Q12365	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	PEX11	Q12462	236 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ROK1	YGL171W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ROK1	YGL171W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ROK1	YGL171W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ROK1	YGL171W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ROK1	YGL171W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ROK1	YGL171W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ROK1	YGL171W	PCI8	P40512	444 aa		3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.7 ms