RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	YPR127W	Q06494	345 aa		0.27	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GRC3	Q07845	632 aa		0.27	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YPL264C	Q08980	353 aa		0.27	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PPT2	Q12036	173 aa		0.27	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.27	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.27	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TIR1	P10863	254 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MER1	P16523	270 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	STF2	P16965	84 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RAD57	P25301	460 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	STE50	P25344	346 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YCR061W	P25639	631 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YCR099C	P25657	155 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SNC1	P31109	117 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TFC1	P32367	649 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	COX13	P32799	129 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	VPS17	P32913	551 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SMF2	P38778	549 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YEN1	P40028	759 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PRM5	P40476	318 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SYG1	P40528	902 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	IAH1	P41734	238 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MIC19	P43594	170 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YJL118W	P47022	219 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ERV29	P53337	310 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YNR071C	P53757	342 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SLT2	Q00772	484 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SPC19	Q03954	165 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SWF1	Q04629	336 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NEJ1	Q06148	342 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GGA1	Q06336	557 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YNG1	Q08465	219 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YPL191C	Q08930	360 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MHT1	Q12525	324 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	STE2	D6VTK4	431 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	Q0255	P03881	472 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	VMA16	P23968	213 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YCR101C	P25607	182 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ERG2	P32352	222 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRE11	P32829	692 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	BLI1	P35727	113 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NUP120	P35729	1037 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RMD6	P39975	231 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	BET5	Q03630	159 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	COA4	Q05809	96 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	DCS1	Q06151	350 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	VPS74	Q06385	345 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MCH4	Q08268	501 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RAD28	Q12021	506 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MED2	Q12124	431 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	INP53	Q12271	1107 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RMP1	Q12530	201 aa		0.26	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TPK3	P05986	398 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	DST1	P07273	309 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GIT1	P25346	518 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SEC65	P29478	273 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	OAC1	P32332	324 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SEC17	P32602	292 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	COS9	P36034	407 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PMU1	P36069	295 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SWD3	P38123	315 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SHE1	P38200	338 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YIL060W	P40519	144 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TTI2	P47168	421 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YGR021W	P53212	290 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YNR048W	P53740	393 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SLM2	P53955	656 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ASI3	P53983	676 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YMR130W	Q04223	302 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NNT1	Q05874	261 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YPR195C	Q06594	109 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	POS5	Q06892	414 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	HRD1	Q08109	551 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MIM1	Q08176	113 aa		0.25	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FYV12	Q08559	129 aa		0.25	□□□□□ -2.37

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