RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A14Q8TBB6 771 aa13.87□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa13.87□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa13.87□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 RINT1Q6NUQ1 792 aa13.86□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa13.85□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 C1orf186Q6ZWK4 172 aa13.85□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 MTRRQ9UBK8 725 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 GPC5P78333 572 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 PKP1Q13835 747 aa13.84□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 FGF13Q92913 245 aa13.84□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 SNX27Q96L92 541 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.84□□□□□ -0.19
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PRAME-212ENST00000485532 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 RAB34Q9BZG1 259 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 CDH7Q9ULB5 785 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-212ENST00000485532 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa13.83□□□□□ -0.2
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PRAME-212ENST00000485532 PDCP20941 246 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 PROZP22891 400 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 HOXA9P31269 272 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 PRPHP41219 470 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 YARSP54577 528 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 XKR4Q5GH76 650 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 PDXDC1Q6P996 788 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 POTEHQ6S545 545 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 DRC1Q96MC2 740 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 UROC1Q96N76 676 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-212ENST00000485532 TCHPQ9BT92 498 aa13.83□□□□□ -0.2
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