RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 CKBP12277 381 aa20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 USP37Q86T82 979 aa20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 FAM212AQ96EL1 285 aa20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 RPS6KA5O75582 802 aa20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 SGPL1O95470 568 aa20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 GPNMBQ14956 572 aa20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 STK33Q9BYT3 514 aa20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 SIX4Q9UIU6 781 aa20.65■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 A0A0U1RQJ8 604 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 MGEA5O60502 916 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 IL18RAPO95256 599 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 DSC3Q14574 896 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 JADE1Q6IE81 842 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 ACAP3Q96P50 834 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 PADI3Q9ULW8 664 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 MYO6Q9UM54 1294 aa20.64■□□□□ 0.9
IFRD1-201ENST00000005558 F8VZ95 297 aa20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 M0QZ92 97 aa20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 GHRP10912 638 aa20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 COL6A1P12109 1028 aa20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 CD52P31358 61 aa20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SURF1Q15526 300 aa20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 DESI2Q9BSY9 194 aa20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF263O14978 683 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ZBTB6Q15916 424 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 KYAT1Q16773 422 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SNX27Q96L92 541 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ASB7Q9H672 318 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 RNF19AQ9NV58 838 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 IPPQ9Y573 584 aa20.63■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 CAND2O75155 1236 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 AKAP5P24588 427 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 AP3M2P53677 418 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 CETN1Q12798 172 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 XKR4Q5GH76 650 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NOD1Q9Y239 953 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 RECQL4O94761 1208 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 GUCY2FP51841 1108 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NCOA4Q13772 614 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ARID3AQ99856 593 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SYT11Q9BT88 431 aa20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SOX5P35711 763 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 PRKCIP41743 596 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 MYL6P60660 151 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 BIRC3Q13489 604 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 CHST12Q9NRB3 414 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SQORQ9Y6N5 450 aa20.61■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 PIK3CAP42336 1068 aa20.6■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.6■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 SHC3Q92529 594 aa20.6■□□□□ 0.89
IFRD1-201ENST00000005558 NT5C1BQ96P26 610 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms