RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W YHL042WP38729 150 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W PRM9P39551 298 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W EDC3P39998 551 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YNL217WP40152 326 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W FLX1P40464 311 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YJL055WP47044 245 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YGL034CP53186 121 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SPP2Q02521 185 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W VBA1Q04301 562 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MSH5Q12175 901 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YDL180WQ12301 547 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YAL064W-BO13512 126 aa-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SIP3P38717 1229 aa-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W PGD1P40356 397 aa-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YRB2P40517 327 aa-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W ARO8P53090 500 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SMC6Q12749 1114 aa-0.7□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YLR462WO13556 202 aa-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SSA3P09435 649 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W VPS21P36017 210 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W ADH5P38113 351 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YEL075CP39972 122 aa-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W POP3P53833 195 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RCE1Q03530 315 aa-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W ASR1Q06834 288 aa-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W PRM3Q08931 133 aa-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YBL008W-AQ3E821 79 aa-0.71□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MET5P47169 1442 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W HFA1P32874 2273 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YCL042WP25572 119 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MEI4P29467 408 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.72□□□□□ -2.52not detected
RDS3YPR094W RRF1P38771 230 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W GDI1P39958 451 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YER189WP40104 122 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W PEX17P40155 199 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W NBP35P52920 328 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W AIF1P52923 378 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SAY1P53324 424 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YNL050CP53952 270 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W CWC27Q02770 301 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YPL077CQ02831 240 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SEC10Q06245 871 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W TPO4Q12256 659 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SWI1P09547 1314 aa-0.72□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPP0P05317 312 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W ERG24P32462 438 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W PRX1P34227 261 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W JNM1P36224 373 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YIA6P40556 373 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W GLG2P47011 380 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W GTO1P48239 356 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YML6P51998 286 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YGL159WP53110 370 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W CUE3P53137 624 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YNR077CP53758 84 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SWS2P53937 143 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W FAR8Q05040 523 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W ATG39Q06159 398 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W COQ10Q08058 207 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W POM33Q12164 279 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YOS9Q99220 542 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W PDR18P53756 1333 aa-0.73□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W FMP27Q06179 2628 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W ATP6P00854 259 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W RNR2P09938 399 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W GAL3P13045 520 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SNA3P14359 133 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W EHD3P28817 500 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SWC5P38326 303 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YEL008WP40001 126 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W GPI8P49018 411 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W KNH1P50112 268 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W MGA1P53050 456 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W GTR2P53290 341 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W MNT4P53745 580 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.74□□□□□ -2.53not detected
RDS3YPR094W YLR460CP54007 376 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W VPS9P54787 451 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W CDC14Q00684 551 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W SPC19Q03954 165 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W YMR252CQ04814 134 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W NBL1Q3E7Y6 73 aa-0.74□□□□□ -2.53
RDS3YPR094W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.75□□□□□ -2.53not detected
RDS3YPR094W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
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