RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	PHB2	P50085	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	NSG2	P53898	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SOR2	Q07786	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	TRM13	Q12383	476 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RDI1	Q12434	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	PSF1	Q12488	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	PMD1	P32634	1753 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	STE18	P18852	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YBR063C	P38083	404 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	DTR1	P38125	572 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RRG9	P40156	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	DAN1	P47178	298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SDT1	P53078	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	DCR2	Q05924	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RFU1	Q08003	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MCA1	Q08601	432 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	FRE7	Q12333	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	JLP1	Q12358	412 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MRPL28	P36527	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SDH4	P37298	181 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	NDT80	P38830	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	PHO90	P39535	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	ICP55	P40051	511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YJR056C	P47115	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	COS10	P52924	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YNL092W	P53934	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	ASI3	P53983	676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RSM23	Q01163	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	AIM39	Q08223	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	FDH1	Q08911	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	NPC2	Q12408	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MRX4	Q12467	430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RRI1	Q12468	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	FSH3	Q99369	266 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SIR2	P06700	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	DAL82	P21705	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	CPR4	P25334	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	FUB1	P25659	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	LIP5	P32875	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SNC2	P33328	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SKT5	P34226	696 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	ANS1	P38832	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	IRC7	P43623	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	AIM25	P47140	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	HMS2	P47175	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	BUD17	P53727	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	GPI15	P53961	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	SAE3	P89114	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MSS11	Q03825	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MFG1	Q07684	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	IZH4	Q99393	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	HEM2	P05373	342 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	ATP5	P09457	212 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	ERD2	P18414	219 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	COQ3	P27680	312 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YHR035W	P38769	630 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	MPM1	P40364	252 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	IBA57	P47158	497 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	NUP57	P48837	541 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YIP4	P53093	235 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	GRE1	Q08969	168 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	COA6	Q3E846	104 aa		4.96	□□□□□ -1.61
UBX2	YML013W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.96	□□□□□ -1.61

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