RNA–Protein interactions for RNA: YHR196W

UTP9, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP9, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP9	YHR196W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	SPP41	P38904	1435 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	CPR3	P25719	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YBL010C	P32788	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	ATG12	P38316	186 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	GLE2	P40066	365 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	VHT1	P53241	593 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	HCH1	P53834	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	POM152	P39685	1337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	SAL1	D6W196	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	GCN3	P14741	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	MRPS28	P21771	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	UGX2	P32772	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	FRE2	P36033	711 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	FRM2	P37261	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	GPX2	P38143	162 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	RCK1	P38622	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	PGD1	P40356	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	GLC8	P41818	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	FAR7	P43592	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	SWS2	P53937	143 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	PLP1	Q04004	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	COQ10	Q08058	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	MDM32	Q12171	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	MHT1	Q12525	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	REP1	P03871	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YCR007C	P25354	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	SRY1	P36007	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YIL060W	P40519	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YIL029C	P40538	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YPS5	P53057	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TOS8	P53147	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	FRE4	P53746	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	HSK3	P69852	69 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	SAE3	P89114	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	ROT1	Q03691	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	SEI1	Q06058	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	RFM1	Q12192	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	SNC1	P31109	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	OAC1	P32332	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YBR137W	P38276	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YHK8	P38776	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	GEP4	P38812	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	MEP2	P41948	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YGR017W	P53210	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YNR048W	P53740	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	MRX11	Q03079	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	BET5	Q03630	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	NKP2	Q06162	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP9	YHR196W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	TIR2	P33890	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	YCR041W	P37265	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	YBR285W	P38354	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	VMA7	P39111	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	YIL067C	P40514	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	BXI1	P48558	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	COQ5	P49017	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	TPN1	P53099	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	TRM10	Q12400	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	TSC11	P40061	1430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	SCO1	P23833	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	YCR006C	P25350	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	COQ3	P27680	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	EGT2	P42835	1041 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	PAC10	P48363	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	UBC12	P52491	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	APS2	Q00381	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP9	YHR196W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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