RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C KAP120Q02932 1032 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FIN1Q03898 291 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C BNA7Q04066 261 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ERP1Q05359 219 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NEJ1Q06148 342 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YDL114WQ07530 308 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C THP3Q12049 470 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RBD2Q12270 262 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HMS1Q12398 434 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PCL9Q12477 304 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C VCX1Q99385 411 aa1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C BRR2P32639 2163 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SOD1P00445 154 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C OPI3P05375 206 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SPO7P18410 259 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MRPS28P21771 286 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CPR2P23285 205 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GIT1P25346 518 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RPS5P26783 225 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PPA2P28239 310 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MCM10P32354 571 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ECT1P33412 323 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SOF1P33750 489 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YKR015CP36111 568 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MRPL39P36533 70 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YBR063CP38083 404 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C DTR1P38125 572 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YMR262WP38430 313 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GPI16P38875 610 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NVJ1P38881 321 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C IES5P40060 125 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C DDI1P40087 428 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FMC1P40491 155 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PFS2P42841 465 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ADO1P47143 340 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C EFM3P47163 339 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RBL2P48606 106 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PCP1P53259 346 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SAY1P53324 424 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MRP51Q02950 344 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MAK3Q03503 176 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YDR102CQ03864 110 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YLR173WQ06247 608 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CTS2Q06350 511 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C IPK1Q06667 281 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FMP45Q07651 309 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MIM1Q08176 113 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MED2Q12124 431 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C COX17Q12287 69 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YDL180WQ12301 547 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa1.92□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MSW1P04803 379 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HEM4P06174 275 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PDE2P06776 526 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PRB1P09232 635 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C YGL041W-AP0C5N3 154 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RPL43BP0CX26 92 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C TAL1P15019 335 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C STE18P18852 110 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C EXG1P23776 448 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C BOS1P25385 244 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FUN26P31381 517 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ARO7P32178 256 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C KRE6P32486 720 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C THI2P38141 450 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SLZ1P40167 298 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C IDP2P41939 412 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C DPB11P47027 764 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RMD9P53140 646 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PAU12P53343 120 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MRPL19P53875 158 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C ASI3P53983 676 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C PET191Q02772 108 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RSM28Q03430 361 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C AIM36Q03798 255 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RVB1Q03940 463 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C GAL83Q04739 417 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C NNT1Q05874 261 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C MDM36Q06820 579 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FRE6Q12473 712 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C HFA1P32874 2273 aa1.91□□□□□ -2.1
GCN4YEL009C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
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