RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	ELO1	P39540	310 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MMT2	Q08970	484 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YPR064W	Q12492	139 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CDC43	P18898	376 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MAK32	P23060	363 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MET30	P39014	640 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	BXI1	P48558	297 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CAB4	P53332	305 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MRS1	P07266	363 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SET4	P42948	560 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MRPL22	P53881	309 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	COX1	P00401	534 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	AAC1	P04710	309 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	STE18	P18852	110 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CNE1	P27825	502 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MRPL6	P32904	214 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HAC1	P41546	238 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DOC1	P53068	250 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MKC7	P53379	596 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RIM9	Q04734	239 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YMR254C	Q04838	102 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CSI2	Q08054	341 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	LAS17	Q12446	633 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		2.55	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MRPL28	P36527	147 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YER181C	P40097	107 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	FMP10	P40098	244 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DAN1	P47178	298 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MRX11	Q03079	207 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	OSW1	Q08692	278 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HAP1	P0CE41	1502 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	THI4	P32318	326 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YJL163C	P46996	555 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YJR120W	P47157	116 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YLR460C	P54007	376 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MED7	Q08278	222 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MNN2	P38069	597 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YJL007C	P47080	104 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PAU12	P53343	120 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GOT1	Q03554	138 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DCS1	Q06151	350 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PET18	P25362	215 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YCR102C	P25608	368 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PMU1	P36069	295 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ERV46	P39727	415 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	APQ12	P40532	138 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	FBP1	P09201	348 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RHB1	P25378	209 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-C	P25383	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SPC29	P33419	253 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YBR184W	P38299	523 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MOB1	P40484	314 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-B	Q12260	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RMP1	Q12530	201 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.54	□□□□□ -2	not detected
TOM1	YDR457W	REE1	P40893	198 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YDR391C	Q04170	232 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MSI1	P13712	422 aa		2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YKL077W	P36081	392 aa		2.54	□□□□□ -2

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