RNA–Protein interactions for RNA: YMR075W

RCO1, Transcript of Essential component of the Rpd3S histone deacetylase complex, yeast

Gene RCO1, Length 2,055 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCO1	YMR075W	CTS2	Q06350	511 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	MIM1	Q08176	113 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	APC9	Q12107	265 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	BBP1	Q12365	385 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	YOS9	Q99220	542 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	MSW1	P04803	379 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	GPA2	P10823	449 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	CCA1	P21269	546 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	GPI12	P23797	304 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	YGL010W	P25338	174 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	SGE1	P33335	543 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	SWC5	P38326	303 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	YAR068W	P39564	161 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	BMT5	P40493	336 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	FIS1	P40515	155 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	PIR5	P46999	287 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	ILM1	P47155	203 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	RMR1	P53060	241 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	CYT2	Q00873	224 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	YDR209C	Q03480	137 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	ATG17	Q06410	417 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	YPL257W	Q08974	193 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	NFI1	Q12216	726 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RCO1	YMR075W	DRS2	P39524	1355 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	FLO9	P39712	1322 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	QCR8	P08525	94 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	MRPS28	P21771	286 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	STP22	P25604	385 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	SWE1	P32944	819 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	GPX1	P36014	167 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YKL070W	P36087	169 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	TVP38	P36164	337 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YPC1	P38298	316 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	ERV15	P38312	142 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	HIS2	P38635	335 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YHL049C	P38722	271 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YHR022C	P38763	256 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	SSO2	P39926	295 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	VAB2	P40003	282 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YKE4	P40544	346 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	AGP3	P43548	558 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	AGX1	P43567	385 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YJL028W	P47062	111 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YJR012C	P47087	207 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YJR079W	P47126	109 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YJR146W	P47174	117 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	OST3	P48439	350 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	PEX31	P53203	462 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YNL050C	P53952	270 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YMD8	Q03697	442 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	MGR3	Q04472	501 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	DCR2	Q05924	578 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	SFH1	Q06168	426 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	ATG5	Q12380	294 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	GEP5	Q12393	293 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	STH1	P32597	1359 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	POX1	P13711	748 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	VPS3	P23643	1011 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YCR102C	P25608	368 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	ATG15	P25641	520 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	CSG2	P35206	410 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	HMT1	P38074	348 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.14	□□□□□ -2.39	RIP-Chip
RCO1	YMR075W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	PRM9	P39551	298 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	AVT2	P39981	480 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	AGE2	P40529	298 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	NUP57	P48837	541 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	GPI8	P49018	411 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	YPL039W	Q03080	316 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	AKR2	Q12013	749 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RCO1	YMR075W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39

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