RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	SLM1	P40485	686 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MGR3	Q04472	501 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YDR114C	Q04597	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YMR254C	Q04838	102 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	TPO3	Q06451	622 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ASA1	Q06822	443 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YDL176W	Q12027	708 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	AVT6	P40074	448 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	RRG9	P40156	214 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ILM1	P47155	203 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YGL114W	P53134	725 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ORM2	Q06144	216 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YPR196W	Q06595	470 aa		2.73	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	SGA1	P08019	549 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	RPD3	P32561	433 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MTC6	P38849	526 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YRB2	P40517	327 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	OKP1	P53298	406 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MSA1	Q08471	629 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	NFI1	Q12216	726 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	FPS1	P23900	669 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ACH1	P32316	526 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ISC10	P32645	267 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YCR041W	P37265	110 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MLH1	P38920	769 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YNL195C	P40168	261 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ATF1	P40353	525 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	AIM20	P40451	204 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	IGO1	P53897	168 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MRPL13	Q02204	264 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	LPP1	Q04396	274 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	HOF1	Q05080	669 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MCM21	Q06675	368 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	DYN1	P36022	4092 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MIG1	P27705	504 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
STE6	YKL209C	PPZ2	P33329	710 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ECM15	P35195	104 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	SRO77	P38163	1010 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	SLM4	P38247	162 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YHK8	P38776	514 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	PSD1	P39006	500 aa		2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	ATP6	P00854	259 aa		2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	GCN4	P03069	281 aa		2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MTH1	P35198	433 aa		2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	RNH201	P53942	307 aa		2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	SPC19	Q03954	165 aa		2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	MRL1	Q06815	381 aa		2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		2.71	□□□□□ -1.97
STE6	YKL209C	COX2	P00410	251 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	VMA11	P32842	164 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	BUR6	P40096	142 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	CIN2	P46670	268 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YJR120W	P47157	116 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	PMT5	P52867	743 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	VAM3	Q12241	283 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	WHI5	Q12416	295 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MET17	P06106	444 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YFL068W	P0CX99	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	ATP10	P18496	279 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	PCL1	P24867	279 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	DOA4	P32571	926 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	PIR5	P46999	287 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YNL046W	P53956	172 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MEH1	Q02205	184 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	FMN1	Q03778	218 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YOR186W	Q08560	144 aa		2.71	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	AFG1	P32317	509 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 112.1 ms