RNA–Protein interactions for RNA: YJL198W

PHO90, Transcript of Low-affinity phosphate transporter, yeast

Gene PHO90, Length 2,646 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO90	YJL198W	SKT5	P34226	696 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PHO90	P39535	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	BDH1	P39714	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	BUR6	P40096	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PEX31	P53203	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	HRD1	Q08109	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	AIM39	Q08223	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	FDH1	Q08911	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RLM1	Q12224	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	VAM3	Q12241	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PRM4	Q12498	284 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	FSH3	Q99369	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	GAL4	P04386	881 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	FLX1	P40464	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	LOH1	P47055	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MTL1	P53214	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	UPS3	Q04006	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YML053C	Q04978	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	NAT5	Q08689	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	AHC1	Q12433	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	STE4	P18851	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	OAC1	P32332	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	CLB6	P32943	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MRPL4	P36517	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YHR035W	P38769	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	POG1	P40473	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	SOL1	P50278	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	COG7	P53195	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YDR366C	P87287	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	CDC14	Q00684	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	NAT4	Q04751	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	LDB18	Q07887	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	CRT10	Q08226	957 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	TFC7	Q12415	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PSF1	Q12488	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	SFG1	Q12507	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	EHD3	P28817	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PEX4	P29340	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	FIS1	P40515	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MEP2	P41948	499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YJR149W	P47177	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	CCC1	P47818	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	OST3	P48439	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YNL143C	P53908	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	GOT1	Q03554	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MFG1	Q07684	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	NRT1	Q08485	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
PHO90	YJL198W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PPH21	P23594	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	STP22	P25604	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	MSK1	P32048	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YUH1	P35127	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	ARP1	P38696	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	CHS7	P38843	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YHR210C	P38893	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	FKH2	P41813	862 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	COS10	P52924	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	ASI3	P53983	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	IRC15	Q02733	499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	CUR1	Q06469	252 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RRI1	Q12468	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	SPT3	P06844	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	SEC59	P20048	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	TCA17	P32613	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	COX13	P32799	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	SFK1	P35735	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	DOA1	P36037	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	OMA1	P36163	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YBR220C	P38318	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YJL193W	P39542	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO90	YJL198W	YIL089W	P40500	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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