RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	YHR177W	P38867	453 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	PAC11	P40960	533 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	HOC1	P47124	396 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	STE24	P47154	453 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	YNL140C	P53910	189 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	APC4	Q04601	652 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	BOP2	Q06150	570 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	YPL278C	Q08990	100 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	RFM1	Q12192	310 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	UNG1	P12887	359 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	STP22	P25604	385 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	TOA2	P32774	122 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	DTR1	P38125	572 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.41	□□□□□ -2.02	not detected
PEX18	YHR160C	ECM8	P38246	354 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	YER184C	P39961	794 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	AYR1	P40471	297 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	HPM1	P40481	377 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	GTO1	P48239	356 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	USE1	P53146	245 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	CDH1	P53197	566 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	RRN9	P53437	365 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	RCF1	Q03713	159 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	URC2	Q04411	772 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	YDL199C	Q12407	687 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	FRE6	Q12473	712 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	SNF8	Q12483	233 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	TRA1	P38811	3744 aa		2.4	□□□□□ -2.02
PEX18	YHR160C	YPR096C	O13587	100 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	CCA1	P21269	546 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	CMK2	P22517	447 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	ZIP1	P31111	875 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	DEP1	P31385	405 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	FMT1	P32785	401 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	SSO1	P32867	290 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	DOA1	P36037	715 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	MRPL17	P36528	281 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	GPX2	P38143	162 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	AIM2	P39721	246 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	ABM1	P47146	123 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	IGO1	P53897	168 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YPL107W	Q02873	248 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YDR541C	Q03049	344 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	RSM10	Q03201	203 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YMR010W	Q03687	405 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	IPK1	Q06667	281 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YDL114W	Q07530	308 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YOL131W	Q08270	108 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YPR202W	Q08993	238 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	GET4	Q12125	312 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	MEC1	P38111	2368 aa		2.4	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	ATP6	P00854	259 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	STE7	P06784	515 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	FUN26	P31381	517 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	TOA1	P32773	286 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	CAB3	P36076	571 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	IST2	P38250	946 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	TRM5	P38793	499 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	APE4	P38821	490 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	FRT2	P39734	528 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	ICE2	P40499	491 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YIL001W	P40560	513 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YDR476C	Q03362	224 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	DYN3	Q04949	312 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	GGA1	Q06336	557 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	ASA1	Q06822	443 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	YLR036C	Q07986	203 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	NFI1	Q12216	726 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	MCT1	Q12283	360 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	RPN6	Q12377	434 aa		2.39	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	UGA1	P17649	471 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	CSM1	P25651	190 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	PMT2	P31382	759 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	MKK1	P32490	508 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	FES1	P38260	290 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	TRR2	P38816	342 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	WSS1	P38838	269 aa		2.38	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	MTW1	P39731	289 aa		2.38	□□□□□ -2.03

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