RNA–Protein interactions for RNA: YER150W

SPI1, Transcript of GPI-anchored cell wall protein involved in weak acid resistance, yeast

Gene SPI1, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPI1	YER150W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	FAR7	P43592	221 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MCM22	P47167	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	PAC10	P48363	199 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	ORM1	P53224	222 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	PCP1	P53259	346 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	HCH1	P53834	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	ERG5	P54781	538 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	TIM8	P57744	87 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SPR6	Q01684	191 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YPL034W	Q03083	165 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YDR249C	Q03787	373 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SUE1	Q06524	206 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	NPC2	Q12408	173 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MRX4	Q12467	430 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	CYC3	P06182	269 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MET2	P08465	486 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	GCN3	P14741	305 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SPO11	P23179	398 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YBR137W	P38276	179 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SLM6	P38343	150 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YBR285W	P38354	144 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	ECM14	P38836	430 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
SPI1	YER150W	GLC8	P41818	229 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MEP2	P41948	499 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	PMT4	P46971	762 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	ILM1	P47155	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	UBC13	P52490	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	UFD1	P53044	361 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	BOR1	P53838	576 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	APS2	Q00381	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MRX11	Q03079	207 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YMR253C	Q04835	414 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	FAR10	Q06001	478 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SEI1	Q06058	285 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	NKP2	Q06162	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	GAT3	Q07928	141 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SRL2	Q12020	392 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	ORT1	Q12375	292 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MHT1	Q12525	324 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SAL1	D6W196	494 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MRS1	P07266	363 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	BAR1	P12630	587 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SPO12	P17123	173 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	STE4	P18851	423 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	OAC1	P32332	324 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	FRE2	P36033	711 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	LAG1	P38703	411 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	MST28	P39552	234 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	EXO1	P39875	702 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YGR151C	P53287	111 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	TRS23	Q03784	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	PSF1	Q12488	208 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPI1	YER150W	POM152	P39685	1337 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	CDC7	P06243	507 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	LSB5	P25369	354 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	CPR3	P25719	182 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	BUB3	P26449	341 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	MRPL9	P31334	269 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	PHD1	P36093	366 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	OMA1	P36163	345 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	SCO2	P38072	301 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	YBR053C	P38235	358 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	YPC1	P38298	316 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	YHK8	P38776	514 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	GEP4	P38812	185 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	ARG2	P40360	574 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	SER33	P40510	469 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	BIR1	P47134	954 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	BXI1	P48558	297 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	MUP1	P50276	574 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	YPS5	P53057	165 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	NMA2	P53204	395 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	HSK3	P69852	69 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	BET5	Q03630	159 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	TRM12	Q04235	462 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SPI1	YER150W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.52	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.2 ms