RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	RDI1	Q12434	202 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ALG7	P07286	448 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YCR100C	P25606	316 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YKR041W	P36134	250 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MRPL3	P36516	390 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ARN1	P38731	627 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	WSC4	P38739	605 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PCL5	P38794	229 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	FMP32	P43557	207 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YPS5	P53057	165 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SHY1	P53266	389 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PDR17	P53844	350 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RMI1	Q02685	241 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YLR036C	Q07986	203 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YDR215C	Q12240	137 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SEC22	P22214	214 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SPC34	P36131	295 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MRPL28	P36527	147 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GUF1	P46943	645 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	POP6	P53218	158 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	AIM34	Q03673	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CCE1	Q03702	353 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GAS2	Q06135	555 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YAP7	Q08182	245 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SPS100	P13130	326 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MCM22	P47167	239 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CCC1	P47818	322 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SWS2	P53937	143 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	DYN2	Q02647	92 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ODC1	Q03028	310 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	DYN3	Q04949	312 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	HPF1	Q05164	967 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	BNA5	Q05979	453 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TIM18	Q08749	192 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ERD1	P16151	362 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PHD1	P36093	366 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MST28	P39552	234 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CSM2	P40465	213 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	UFE1	P41834	346 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YJL043W	P47053	257 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TPN1	P53099	579 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	COG7	P53195	279 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	COS1	P53822	381 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TDA1	Q03533	586 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	DPP1	Q05521	289 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MRX4	Q12467	430 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CTA1	P15202	515 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	DBF2	P22204	572 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	INO2	P26798	304 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PDC2	P32896	925 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	THI80	P35202	319 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YIL029C	P40538	142 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YPR091C	Q06833	770 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	COQ10	Q08058	207 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	COX5A	P00424	153 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CDC8	P00572	216 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MET2	P08465	486 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	GLN3	P18494	730 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TRX3	P25372	127 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MDM31	P38880	579 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PCI8	P40512	444 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	AZF1	P41696	914 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	CPR7	P47103	393 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	MAK3	Q03503	176 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	BCH1	Q05029	724 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	PEX30	Q06169	523 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	YOL024W	Q08172	172 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	THI20	Q08224	551 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	ERV2	Q12284	196 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	TFC7	Q12415	435 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOP1	YOL006C	IGO2	Q9P305	131 aa		2.94	□□□□□ -1.94

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