RNA–Protein interactions for RNA: YMR306W

FKS3, Transcript of Protein involved in spore wall assembly, yeast

Gene FKS3, Length 5,358 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FKS3	YMR306W	YPR015C	Q12531	247 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ENA1	P13587	1091 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	STE18	P18852	110 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FMC1	P40491	155 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	EGT2	P42835	1041 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YNL165W	P53891	406 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YLR152C	P54072	576 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ENA2	Q01896	1091 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PEX30	Q06169	523 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ARR2	Q06597	130 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TAF3	Q12297	353 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ENA5	Q12691	1091 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SIR3	P06701	978 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YKL102C	P34249	101 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YER084W	P40057	128 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YIL012W	P40551	113 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TNA1	P53322	534 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RTR2	Q12378	196 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ATG40	Q99325	256 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FPS1	P23900	669 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.23	□□□□□ -2.05	not detected
FKS3	YMR306W	PPG1	P32838	368 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SRO77	P38163	1010 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RRG9	P40156	214 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FLX1	P40464	311 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	AAH1	P53909	347 aa		2.23	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	AFG1	P32317	509 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	OAC1	P32332	324 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MRPL6	P32904	214 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ECM4	P36156	370 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	IPT1	P38954	527 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YFL051C	P43552	160 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	NCA3	P46955	337 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CCC1	P47818	322 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SRL1	Q08673	210 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RAS1	P01119	309 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YBL010C	P32788	280 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.22	□□□□□ -2.05	not detected
FKS3	YMR306W	MRPL16	P38064	232 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	GPI18	P38211	433 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	QDR1	P40475	563 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TSA2	Q04120	196 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YDR391C	Q04170	232 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	KIN28	P06242	306 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SAM35	P14693	329 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	BOS1	P25385	244 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YCR101C	P25607	182 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	DAL3	P32459	195 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	NIT3	P49954	291 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PMT5	P52867	743 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PGA1	P53896	198 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	COG5	P53951	403 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	AIM36	Q03798	255 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FRE8	Q12209	686 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	VPS17	P32913	551 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MSS11	Q03825	758 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PIN3	Q06449	215 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	BRE4	Q07660	1125 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	NFI1	Q12216	726 aa		2.22	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	COX2	P00410	251 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	PMR1	P13586	950 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	ECT1	P33412	323 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	FRM2	P37261	193 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	RPP1	P38786	293 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	RSM24	Q03976	319 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	YMR087W	Q04299	284 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	NEJ1	Q06148	342 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	SOD2	P00447	233 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	DBF2	P22204	572 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	OKP1	P53298	406 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	YLR283W	Q05867	314 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	YLR173W	Q06247	608 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	GPN3	Q06543	272 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	YDL176W	Q12027	708 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FKS3	YMR306W	SGA1	P08019	549 aa		2.21	□□□□□ -2.06

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