RNA–Protein interactions for RNA: YMR275C

BUL1, Transcript of Ubiquitin-binding component of the Rsp5p E3-ubiquitin ligase complex, yeast

Gene BUL1, Length 2,931 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUL1	YMR275C	UBX6	P47049	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YGR042W	P53227	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RAX1	Q08760	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ENV7	Q12003	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	MTR10	Q99189	972 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	QCR7	P00128	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PDX1	P16451	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	UBS1	P38290	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YER184C	P39961	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	MNN5	P46982	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YGL204C	P53089	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
BUL1	YMR275C	PRB1	P09232	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	NUD1	P32336	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	IKS1	P47042	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	FMP48	P53233	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	KEI1	Q06346	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ERF2	Q06551	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ORT1	Q12375	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RDI1	Q12434	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	DBF20	P32328	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	MKS1	P34072	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SIT1	P39980	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	CTF19	Q02732	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	MRP51	Q02950	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PEX30	Q06169	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SPS2	P08459	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ERG8	P24521	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	NFS1	P25374	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	KRE6	P32486	720 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	CLG1	P35190	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	FRM2	P37261	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ATG4	P53867	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	COA4	Q05809	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PPQ1	P32945	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YLR152C	P54072	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	HEM25	Q07534	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ODC2	Q99297	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SED4	P25365	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	THI4	P32318	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ATF1	P40353	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YJL016W	P47072	561 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	AAH1	P53909	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	AIM36	Q03798	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PLP1	Q04004	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	TMS1	Q12116	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	TEL1	P38110	2787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SPO7	P18410	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YBL010C	P32788	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SNC2	P33328	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	KAE1	P36132	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YIL060W	P40519	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PHB1	P40961	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	CIN2	P46670	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	MSY1	P48527	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	MCH4	Q08268	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	HXT2	P23585	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ADH7	P25377	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PRY1	P47032	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	BXI1	P48558	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	NIT3	P49954	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	MRPL50	P53724	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	ERP4	Q12450	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
BUL1	YMR275C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	POP6	P53218	158 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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