RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	YOL131W	Q08270	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SRO7	Q12038	1033 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YLL056C	Q12177	298 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YLR046C	Q12253	270 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RMD5	Q12508	421 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	POF1	P25576	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MRPL9	P31334	269 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MSS51	P32335	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	FLO10	P36170	1169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	QDR3	P38227	689 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PEX7	P39108	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PAN6	P40459	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YFR020W	P43600	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PMT4	P46971	762 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	STE24	P47154	453 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	NBP35	P52920	328 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YGL159W	P53110	370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PKP2	P53170	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SPP2	Q02521	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PAM18	Q07914	168 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	IZH3	Q07959	543 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	FYV7	Q12247	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YDL199C	Q12407	687 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	KIN28	P06242	306 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	UTR1	P21373	530 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	GPI12	P23797	304 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ADE1	P27616	306 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MSN2	P33748	704 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YHR122W	P38829	231 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	FMO1	P38866	432 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YHR177W	P38867	453 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MBB1	P39534	108 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ERV46	P39727	415 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	LAS21	P40367	830 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	IRC24	P40580	263 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	BAP3	P41815	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CHA4	P43634	648 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YJR154W	P47181	346 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ERV29	P53337	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YNL181W	P53878	407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SNO1	Q03144	224 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YDR124W	Q04608	324 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TMA10	Q06177	86 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RIF2	Q06208	395 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	UBA3	Q99344	299 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YLL053C	P0CD98	152 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	NAM2	P11325	894 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	BUB3	P26449	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	LAC1	P28496	418 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YKL162C	P36052	402 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	GMH1	P36125	273 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YBR013C	P38215	129 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SHG1	P38337	142 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SUR2	P38992	349 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YAR1	P46683	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SAM50	P53969	484 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MRP51	Q02950	344 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MSC1	Q03104	513 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	OST6	Q03723	332 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	DUS4	Q06063	367 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SSK1	Q07084	712 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	DDC1	Q08949	612 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RAD28	Q12021	506 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YDL176W	Q12027	708 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YLR422W	Q06409	1932 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	COX2	P00410	251 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	HTB2	P02294	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CDC7	P06243	507 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	URA6	P15700	204 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	FUN14	P18411	198 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SNF6	P18888	332 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RIB1	P38066	345 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
UBX2	YML013W	RCK1	P38622	512 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TAD2	P47058	250 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	EAF6	P47128	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PRM8	P53174	237 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	GND2	P53319	492 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6

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