RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	TMS1	Q12116	473 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YRM1	Q12340	786 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RDI1	Q12434	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	STE7	P06784	515 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	COX9	P07255	59 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YCR100C	P25606	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MRP17	P28778	131 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ITR1	P30605	584 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SRB6	P32570	121 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	VPS17	P32913	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	BNA4	P38169	460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	BMT5	P40493	336 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ICE2	P40499	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YIL024C	P40543	189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PHB1	P40961	287 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	NIT2	P47016	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	IBA57	P47158	497 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RAD17	P48581	401 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YGL101W	P53144	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ODC1	Q03028	310 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YHM2	Q04013	314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ANT1	Q06497	328 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CRT10	Q08226	957 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	BTS1	Q12051	335 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MSB2	P32334	1306 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	REV1	P12689	985 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LDS1	P31379	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SUA5	P32579	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PXA2	P34230	853 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ECM15	P35195	104 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MRPL36	P36531	177 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	IKI1	P38874	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SNN1	P48232	102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	VEL1	P53058	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YGL159W	P53110	370 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CDH1	P53197	566 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
TVP38	YKR088C	PNG1	Q02890	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SPC19	Q03954	165 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PEX30	Q06169	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CYK3	Q07533	885 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	GRC3	Q07845	632 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	EAF3	Q12432	401 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SKS1	Q12505	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	FSH3	Q99369	266 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	KIN28	P06242	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PRB1	P09232	635 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CBS1	P14066	229 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SEC22	P22214	214 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	STE50	P25344	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	CWH43	P25618	953 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	NAM9	P27929	486 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MRP20	P32387	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ECM25	P32525	599 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YEF1	P32622	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SFK1	P35735	353 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	DOA1	P36037	715 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	UIP5	P36137	443 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	RRN10	P38204	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	GTT1	P40582	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	MAD2	P40958	196 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	TOS2	P50078	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SGF73	P53165	657 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YGR026W	P53217	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	TGL2	P54857	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TVP38	YKR088C	YEH1	Q07804	573 aa		4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.2 ms