RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	EFM1	P38732	585 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	YER184C	P39961	794 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	HIT1	P46973	164 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	COQ5	P49017	307 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	EMC4	P53073	190 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	SED5	Q01590	340 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	PIR1	Q03178	341 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	ARO80	Q04052	950 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	PIN3	Q06449	215 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	RAD3	P06839	778 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.16	□□□□□ -1.9	not detected
MTD1	YKR080W	TIP20	P33891	701 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	YKL162C	P36052	402 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	FET3	P38993	636 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	TPC1	P53257	314 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	YPR1	Q12458	312 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MTD1	YKR080W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SGE1	P33335	543 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	TAE1	P38340	232 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YER189W	P40104	122 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	PMT4	P46971	762 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CIS3	P47001	227 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	NUP84	P52891	726 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	MND1	P53102	219 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SWS2	P53937	143 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YPL080C	Q02826	108 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YLR046C	Q12253	270 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	EMP46	Q12396	444 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	PRM4	Q12498	284 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	OM45	P16547	393 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CSG2	P35206	410 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	NBP35	P52920	328 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	VOA1	P53262	265 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	OKP1	P53298	406 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	ZRT1	P32804	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RCK1	P38622	512 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YHR035W	P38769	630 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SPT8	P38915	602 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	LOH1	P47055	219 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YGR067C	P53243	804 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RRG8	Q06109	277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	ERD1	P16151	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	DAL81	P21657	970 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CYM1	P32898	989 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	MRPL40	P36534	297 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CTM1	P38818	585 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YJR079W	P47126	109 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SDS23	P53172	527 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YML096W	Q04489	525 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	TAF9	Q05027	157 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	VAC14	Q06708	880 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	DAL82	P21705	255 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	ZIP1	P31111	875 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YKL187C	P34231	750 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YET1	P35723	206 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RSM25	P40496	264 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	COG7	P53195	279 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YGR266W	P53326	701 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	INP1	Q03694	420 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	INP2	Q03824	705 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SNX41	Q04053	625 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YPL278C	Q08990	100 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	OCA6	Q12454	224 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	UBR1	P19812	1950 aa		3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.6 ms