RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	REP1	P03871	373 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	CTM1	P38818	585 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ILM1	P47155	203 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	DIA1	P54005	336 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ECM19	Q06011	112 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	NKP2	Q06162	153 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YOL024W	Q08172	172 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PDR18	P53756	1333 aa		2.58	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ERD1	P16151	362 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ACB1	P31787	87 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YEL043W	P32618	956 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	SRB2	P34162	210 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPC37	P36121	282 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PES4	P39684	611 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RRG9	P40156	214 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PMT4	P46971	762 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPN14	P53196	417 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YGR168C	P53293	376 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	FAR8	Q05040	523 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	STE23	Q06010	1027 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PSY3	Q12318	242 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YDR262W	Q12331	272 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PRM4	Q12498	284 aa		2.57	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	SAL1	D6W196	494 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPO26	P20435	155 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YKL187C	P34231	750 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ECM4	P36156	370 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	TVP38	P36164	337 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RCK1	P38622	512 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	DSE1	P40077	573 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	SLM1	P40485	686 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	SDS23	P53172	527 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ORM1	P53224	222 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	MAL13	P53338	473 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	SFH1	Q06168	426 aa		2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	JIP3	O13555	125 aa		2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	HMT1	P38074	348 aa		2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YIL001W	P40560	513 aa		2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YJR079W	P47126	109 aa		2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	TFC7	Q12415	435 aa		2.55	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	HAP2	P06774	265 aa		2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPB9	P27999	122 aa		2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	KDX1	P36005	433 aa		2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	SRL3	P36167	246 aa		2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	CAJ1	P39101	391 aa		2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	ATG15	P25641	520 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	HSM3	P38348	480 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	VPS45	P38932	577 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	SPO73	P40031	143 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	OSW5	P40219	148 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	INA22	P40576	216 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YJL144W	P47009	104 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	GPI8	P49018	411 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	NUP84	P52891	726 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	YML108W	Q03759	105 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	PLP1	Q04004	230 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	MGR3	Q04472	501 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	MIM1	Q08176	113 aa		2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YKR070W	YKR070W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	INO2	P26798	304 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	RIB7	P33312	244 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	TDA11	P38854	504 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	POP2	P39008	433 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	MEP1	P40260	492 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	LSB1	P53281	241 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	YKR005C	Q02203	525 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YKR070W	YKR070W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.7 ms