RNA–Protein interactions for RNA: YJL115W

ASF1, Transcript of Nucleosome assembly factor, yeast

Gene ASF1, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ASF1	YJL115W	CLG1	P35190	452 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SPT10	P35208	640 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ECM14	P38836	430 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	BUR6	P40096	142 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SLD3	P53135	668 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	AIM36	Q03798	255 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	DAL80	P26343	269 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	NDC1	P32500	655 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ECT1	P33412	323 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SDS22	P36047	338 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	DTR1	P38125	572 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	IPT1	P38954	527 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YIL029C	P40538	142 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SCW11	P53189	542 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SAY1	P53324	424 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SAM50	P53969	484 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SED1	Q01589	338 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GRX5	Q02784	150 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GPI17	Q04080	534 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	MET3	P08536	511 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YKR015C	P36111	568 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ECM4	P36156	370 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SHE1	P38200	338 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YBR285W	P38354	144 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	FLX1	P40464	311 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	FMC1	P40491	155 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	MSS2	P40990	351 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SLS1	P42900	643 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	TLG1	Q03322	224 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YDR391C	Q04170	232 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.73	□□□□□ -1.49	not detected
ASF1	YJL115W	COX5B	P00425	151 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ENA1	P13587	1091 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	PCL1	P24867	279 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	MNS1	P32906	549 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YIL012W	P40551	113 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	EGT2	P42835	1041 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	SBH2	P52871	88 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YIP5	P53108	310 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YMR279C	Q03263	540 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GAL83	Q04739	417 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	MED11	Q99278	115 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	PDE2	P06776	526 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YML003W	P0CF16	290 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	MCH2	P36032	473 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	FRM2	P37261	193 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	NTA1	P40354	457 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	CTK2	P46962	323 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	CCC1	P47818	322 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	PPT1	P53043	513 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	MTL1	P53214	551 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YNR048W	P53740	393 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	AAH1	P53909	347 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	NRK1	P53915	240 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	CIK1	Q01649	594 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GMC1	Q04399	608 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YDR514C	Q04408	483 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	RNH1	Q04740	348 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	YLR173W	Q06247	608 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	GSH2	Q08220	491 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	TRM10	Q12400	293 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	FSH3	Q99369	266 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ASF1	YJL115W	HNM1	P19807	563 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ASF1	YJL115W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
ASF1	YJL115W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ASF1	YJL115W	PUG1	P40100	303 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ASF1	YJL115W	DLS1	P40366	167 aa		5.71	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.3 ms