RNA–Protein interactions for RNA: YGR174C

CBP4, Transcript of Mitochondrial protein required for assembly of cytochrome bc1 complex, yeast

Gene CBP4, Length 513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP4	YGR174C	SPC3	Q12133	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	MCT1	Q12283	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	TCA17	P32613	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SPT10	P35208	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SKG1	P36169	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YBR241C	P38142	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RPP1	P38786	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	ALP1	P38971	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	FAR7	P43592	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RET2	P43621	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SSY5	P47002	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SPC19	Q03954	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	GPI17	Q04080	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	MLC2	Q06580	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SWA2	Q06677	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SCEI	P03882	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	MET3	P08536	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	ENA1	P13587	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	CPR2	P23285	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	PPA2	P28239	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	BUR6	P40096	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	MAM33	P40513	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	LOH1	P47055	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RRN9	P53437	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RSM23	Q01163	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	IRC25	Q07951	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	VIK1	Q12045	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	FRE8	Q12209	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	NAM2	P11325	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	APA2	P22108	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	DBF2	P22204	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RPC34	P32910	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YKL102C	P34249	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CBP4	YGR174C	SFH5	P47008	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YJL016W	P47072	561 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YIP5	P53108	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YNR064C	P53750	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	NFI1	Q12216	726 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SUR1	P33300	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	FAT1	P38225	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SIC1	P38634	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SBE22	P38814	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	FLX1	P40464	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	STB1	P42845	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	PRM8	P53174	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	SPR6	Q01684	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RIM9	Q04734	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	ASA1	Q06822	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
CBP4	YGR174C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBP4	YGR174C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
CBP4	YGR174C	SIR3	P06701	978 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	BOS1	P25385	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	CHL4	P38907	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	BNA2	P47125	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	EXG2	P52911	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	COS10	P52924	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	NUP49	Q02199	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	GAT3	Q07928	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	MCH4	Q08268	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	MSA1	Q08471	629 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
CBP4	YGR174C	OPI3	P05375	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	STE18	P18852	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	MRPS28	P21771	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	VMA11	P32842	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBP4	YGR174C	YKR015C	P36111	568 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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