RNA–Protein interactions for RNA: YDL007W

RPT2, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT2, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT2	YDL007W	TVP23	P38962	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YNL195C	P40168	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ASK10	P48361	1146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	NRG1	Q03125	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	OST6	Q03723	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RIM13	Q03792	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	HLR1	Q04429	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RNH202	Q05635	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PHO5	P00635	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RBK1	P25332	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YCR101C	P25607	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CDC50	P25656	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ITR1	P30605	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	FUN26	P31381	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ATS1	P31386	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	DRE2	P36152	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SDH4	P37298	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PEX32	P38292	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	AXL2	P38928	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SWC4	P53201	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	COX18	P53239	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	HCH1	P53834	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	RHO4	Q00246	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RPT2	YDL007W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	HOF1	Q05080	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YPD1	Q07688	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CRT10	Q08226	957 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	DCI1	Q08558	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ATX2	Q12067	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	TRM13	Q12383	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PCL9	Q12477	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SCEI	P03882	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	GAL80	P04387	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CDC7	P06243	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	POF1	P25576	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MSK1	P32048	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CLB6	P32943	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SCO2	P38072	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	THI2	P38141	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	UBA4	P38820	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	CHL4	P38907	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	AGE2	P40529	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	BUL1	P48524	976 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	SCS3	P53012	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YGL185C	P53100	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YGL117W	P53133	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PAU12	P53343	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	FRE4	P53746	719 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YNL140C	P53910	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	NRK1	P53915	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	GPI15	P53961	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	STP4	Q07351	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	NDE2	Q07500	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	PST1	Q12355	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT2	YDL007W	QCR7	P00128	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PHO2	P07269	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SPS4	P09937	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MRPL8	P22353	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YMC1	P32331	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	COS9	P36034	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SRO77	P38163	1010 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	GET2	P40056	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MEP1	P40260	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SNM1	P40993	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	IDP2	P41939	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SOL1	P50278	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	YGR079W	P53249	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	MEP3	P53390	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	BTS1	Q12051	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	PER33	Q12144	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	TFC7	Q12415	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	FSH3	Q99369	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	HAP2	P06774	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT2	YDL007W	SEC59	P20048	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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