RNA–Protein interactions for RNA: tR(UCU)Q1

tR(UCU)Q1, Transcript of Mitochondrial arginine tRNA (tRNA-Arg), yeastyeast

Gene tR(UCU)Q1, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YHR086W-AQ3E746 53 aa2.07□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MPP10P47083 593 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TDH1P00360 332 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TFS1P14306 219 aa2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.05□□□□□ -2.08not detected
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ZRT1P32804 376 aa2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPC1P38298 316 aa2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SWC4P53201 476 aa2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PDR16P53860 351 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SWT21P53873 357 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SLM2P53955 656 aa2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PAN1P32521 1480 aa2.05□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 AEP1P32493 518 aa2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SIF2P38262 535 aa2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YFR054CP43622 192 aa2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YJL016WP47072 561 aa2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ISD11Q6Q560 94 aa2.04□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUP157P40064 1391 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RAD7P06779 565 aa2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YKL162CP36052 402 aa2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPT32P51996 222 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 COG7P53195 279 aa2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CAB4P53332 305 aa2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MRS2Q01926 470 aa2.03□□□□□ -2.08
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TOM40P23644 387 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RCF1Q03713 159 aa2.02□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 IZH4Q99393 312 aa2.02□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YOR062CP36025 268 aa2.01□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPL150WQ12152 901 aa2.01□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BMH1P29311 267 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YHL026CP38740 315 aa2□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YHI9P38765 294 aa2□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GDS1P41913 522 aa2□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GAL3P13045 520 aa1.99□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPE1P46969 238 aa1.99□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PML1Q07930 204 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TIF34P40217 347 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 STE23Q06010 1027 aa1.98□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 APC9Q12107 265 aa1.98□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NFI1Q12216 726 aa1.98□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RAD10P06838 210 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ERG2P32352 222 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 KRE6P32486 720 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 AVT7P40501 490 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YML018CQ03730 393 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PSY3Q12318 242 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPR064WQ12492 139 aa1.97□□□□□ -2.09
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 POP8P38208 133 aa1.96□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PHO89P38361 574 aa1.96□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YBL112CQ3E7Y4 105 aa1.96□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 COT1P32798 439 aa1.95□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DRE2P36152 348 aa1.95□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SPT8P38915 602 aa1.95□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SEN34P39707 275 aa1.95□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SAM4Q08985 325 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BOL1Q3E793 110 aa1.95□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YCR102CP25608 368 aa1.94□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CAT2P32796 670 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPL039WQ03080 316 aa1.94□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ECM18Q04623 453 aa1.94□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TAZ1Q06510 381 aa1.94□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ATG15P25641 520 aa1.93□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SUA5P32579 426 aa1.93□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SMT3Q12306 101 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 UIP5P36137 443 aa1.92□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDR089WP38966 869 aa1.92□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 AYR1P40471 297 aa1.92□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PBP4Q07362 185 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YOR114WQ12219 294 aa1.92□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NAS2P40555 220 aa1.91□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 COX16P47081 118 aa1.91□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DPP1Q05521 289 aa1.91□□□□□ -2.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CSG2P35206 410 aa1.9□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SWC5P38326 303 aa1.9□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 LSM4P40070 187 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC40P40968 455 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YJL118WP47022 219 aa1.9□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PPH21P23594 369 aa1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SCM4P32564 187 aa1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPC37P36121 282 aa1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GON7P46984 123 aa1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DAD3P69850 94 aa1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YOL019WQ08157 551 aa1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PAA1Q12447 191 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPR1Q12458 312 aa1.89□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC37P06101 506 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GDH2P33327 1092 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.6 ms