RNA–Protein interactions for RNA: YPL203W

TPK2, Transcript of cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit, yeast

Gene TPK2, Length 1,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPK2	YPL203W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YPI1	P43587	155 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	MNN5	P46982	586 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	PAC10	P48363	199 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	KEL2	P50090	882 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	AVT4	P50944	713 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RPN14	P53196	417 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ODC1	Q03028	310 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	MMT1	Q03218	510 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	DCR2	Q05924	578 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	FAR10	Q06001	478 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YOR214C	Q12282	236 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RPN6	Q12377	434 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SNF8	Q12483	233 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SKS1	Q12505	502 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ERD1	P16151	362 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CTR86	P25355	563 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RAD51	P25454	400 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	PBN1	P25580	416 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YCR051W	P25631	222 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ERG9	P29704	444 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	NPL6	P32832	435 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	REC114	P32841	428 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YOR062C	P36025	268 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YDR089W	P38966	869 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	TRS85	P46944	698 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	MKC7	P53379	596 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YDR476C	Q03362	224 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YDR249C	Q03787	373 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	URC2	Q04411	772 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	KRE28	Q04431	385 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SMA2	Q04658	369 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RSA1	Q08932	381 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YRM1	Q12340	786 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RTN2	Q12443	393 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	MET2	P08465	486 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	PDX1	P16451	410 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ATG15	P25641	520 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ERG3	P32353	365 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	NUF2	P33895	451 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	LTV1	P34078	463 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	PTC1	P35182	281 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	REE1	P40893	198 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	GAB1	P41733	394 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SRB7	P47822	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	POP6	P53218	158 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SWP1	Q02795	286 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	NAT4	Q04751	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	BUR2	Q05949	395 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	NSL1	Q12143	216 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YPR096C	O13587	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CCA1	P21269	546 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CLB3	P24870	427 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	ATP7	P30902	174 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YEF1	P32622	495 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	MRPL17	P36528	281 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YBR032W	P38223	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	STP2	P38704	541 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	BIG1	P38813	335 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CDH1	P53197	566 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	TPC1	P53257	314 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	COS6	P53344	381 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	DSL1	P53847	754 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	NCE101	Q02820	53 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SDC1	Q03323	175 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	HSP31	Q04432	237 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SEI1	Q06058	285 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	PSY3	Q12318	242 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SCM3	Q12334	223 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	IRA1	P18963	3092 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TPK2	YPL203W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97

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