RNA–Protein interactions for RNA: YMR018W

YMR018W, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to human PEX5Rp, yeastyeast

Gene YMR018W, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR018WYMR018W BSC6Q08280 497 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SCP1Q08873 200 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YPL257WQ08974 193 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W CAP2P13517 287 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W PHO81P17442 1178 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W STE50P25344 346 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RNP1P32385 249 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ARO4P32449 370 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SRB5P32585 307 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W FRE1P32791 686 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SRB2P34162 210 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W COS9P36034 407 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W LAG1P38703 411 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YHL041WP38730 149 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W WSC4P38739 605 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W BIG1P38813 335 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W NSG1P38837 291 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W PRP39P39682 629 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W HAT2P39984 401 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W HIS6P40545 261 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SMK1P41808 388 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W NSE4P43124 402 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W MOG1P47123 218 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W AZR1P50080 613 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W PHB2P50085 310 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W AVT4P50944 713 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YNR066CP53752 436 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W BOR1P53838 576 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SNO1Q03144 224 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SHH3Q04487 196 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RNH202Q05635 350 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ATG39Q06159 398 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YPR202WQ08993 238 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SRL2Q12020 392 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W UBR1P19812 1950 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W TPK3P05986 398 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ATP5P09457 212 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W BUB3P26449 341 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RAD14P28519 371 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.11□□□□□ -1.91not detected
YMR018WYMR018W ADH5P38113 351 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W DTR1P38125 572 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W BNA4P38169 460 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YPC1P38298 316 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W MBA1P38300 278 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W TAE1P38340 232 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W HIS2P38635 335 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W EFM1P38732 585 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W GEP4P38812 185 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W VPS52P39904 641 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YEL068CP39977 110 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W FMC1P40491 155 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YJL132WP47014 750 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ECM27P47144 725 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W EFM3P47163 339 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YJR149WP47177 404 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W NUP57P48837 541 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ASN2P49090 572 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W FLC3P53121 802 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SGF73P53165 657 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YNL184CP53876 108 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W NUP49Q02199 472 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W TRI1Q05024 226 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W BSP1Q06604 576 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W ECM30Q06673 1274 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W BER1Q06688 274 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SSK1Q07084 712 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W GPM2Q12008 311 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W MDM32Q12171 622 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YDR018CQ12185 396 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W CRC1Q12289 327 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YLR111WQ12528 110 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W SLO1Q3E784 85 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W MED11Q99278 115 aa3.11□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YFL068WP0CX99 160 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YLL066W-AP0CY00 160 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W YLL067W-AP0CY01 160 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR018WYMR018W NAM2P11325 894 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.9 ms