RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STF2	YGR008C	YGL114W	P53134	725 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	COG2	P53271	262 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YGR126W	P53274	230 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RCF2	P53721	224 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SWP1	Q02795	286 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	EKI1	Q03764	534 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	HLR1	Q04429	423 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YDR222W	Q04925	415 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	ECI1	Q05871	280 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	TMA16	Q08687	178 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	FDH1	Q08911	376 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	MCP1	Q12106	302 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	MED2	Q12124	431 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SRN2	Q99176	213 aa		0.76	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SEC12	P11655	471 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YCR100C	P25606	316 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SMI1	P32566	505 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PDC2	P32896	925 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PTH2	P34222	208 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YOR062C	P36025	268 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	COS9	P36034	407 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YBR096W	P38256	230 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PEX32	P38292	413 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	MSG5	P38590	489 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	ANS1	P38832	159 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	MIG3	P39943	394 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SLM1	P40485	686 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	CAB2	P40506	365 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	GET1	P53192	235 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YGR111W	P53265	400 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	HAL1	Q01766	294 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	CAC2	Q04199	468 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	ATG39	Q06159	398 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	NUS1	Q12063	375 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	HOS1	Q12214	470 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	ATG34	Q12292	412 aa		0.75	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PCL2	P25693	308 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	MGT1	P26188	188 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	THI4	P32318	326 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	CBP4	P37267	147 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PCL6	P40038	420 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YJL213W	P40896	331 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	TRS85	P46944	698 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YGR017W	P53210	297 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RHO4	Q00246	291 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SCS7	Q03529	384 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	URC2	Q04411	772 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YOL019W	Q08157	551 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	NMD4	Q12129	218 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YLL056C	Q12177	298 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YPL247C	Q12523	523 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.74	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	REP2	P03872	296 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	CDC15	P27636	974 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SUR1	P33300	382 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SDH3	P33421	198 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YKL075C	P36083	450 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	SRO77	P38163	1010 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	VPS41	P38959	992 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	HAT2	P39984	401 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YEN1	P40028	759 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	BUR6	P40096	142 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PTR3	P43606	678 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YJL016W	P47072	561 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YJR154W	P47181	346 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	TIS11	P47977	285 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YNL058C	P53947	316 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YDR387C	Q04162	555 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	FSH2	Q05015	223 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	MHR1	Q06630	226 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	IRC19	Q07843	230 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YOR029W	Q12243	111 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.73	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	STE2	D6VTK4	431 aa		0.72	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.72	□□□□□ -2.29	not detected
STF2	YGR008C	YNL320W	P42840	284 aa		0.72	□□□□□ -2.29
STF2	YGR008C	AGP3	P43548	558 aa		0.72	□□□□□ -2.29

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