RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	STD1	Q02794	444 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SWC7	Q06707	132 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ADK2	P26364	225 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NEM1	P38757	446 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YJR115W	P47152	169 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PRM8	P53174	237 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ATG10	Q07879	167 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TRI1	Q05024	226 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MCH1	Q07376	486 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DFG16	Q99234	619 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
TOM1	YDR457W	POF1	P25576	258 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	LAC1	P28496	418 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YOR062C	P36025	268 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	WSS1	P38838	269 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YHR180W	P38868	163 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MOB2	P43563	287 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RRT5	P43607	289 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MUP1	P50276	574 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GND2	P53319	492 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ERV29	P53337	310 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YDR249C	Q03787	373 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	FMP16	Q12497	93 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	Q0255	P03881	472 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CDC21	P06785	304 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TRS65	P32893	560 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SUR1	P33300	382 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SHR5	P41912	237 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HXT16	P47185	567 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	EAF3	Q12432	401 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	UGA4	P32837	571 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PPZ2	P33329	710 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ERG25	P53045	309 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HHO1	P53551	258 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	EOS1	P53938	366 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PRR2	Q12310	699 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CHS1	P08004	1131 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ERD2	P18414	219 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YBR139W	P38109	508 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YGL118C	P53132	145 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RIM8	P53179	542 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YMR279C	Q03263	540 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PIN2	Q12057	282 aa		2.58	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	VMA21	P41806	77 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PFA3	P42836	336 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YNL034W	P53963	612 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YNL018C	P53976	612 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YPL068C	Q02749	293 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	FMP30	Q02883	468 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	EAR1	Q03212	550 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GRX8	Q05926	109 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	XYL2	Q07993	356 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YOR342C	Q12182	319 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DAD1	Q12248	94 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SOD2	P00447	233 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HEM4	P06174	275 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
TOM1	YDR457W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CLG1	P35190	452 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SOL2	P37262	315 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TAE1	P38340	232 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PSD1	P39006	500 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	BUD32	P53323	261 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TIM10	P87108	93 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SMP3	Q04174	516 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DAL4	Q04895	635 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NUT2	Q06213	157 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
TOM1	YDR457W	HUT1	Q12520	339 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MBA1	P38300	278 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	AGP3	P43548	558 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GON7	P46984	123 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TTI2	P47168	421 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PEX21	P50091	288 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CRZ1	P53968	678 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YLR152C	P54072	576 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YDC1	Q02896	317 aa		2.57	□□□□□ -2

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