RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	TPC1	P53257	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	HOL1	P53389	586 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YAT1	P80235	687 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PEX25	Q02969	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	DML1	Q03652	475 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	FIN1	Q03898	291 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ELP6	Q04868	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	BUR2	Q05949	395 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MDM36	Q06820	579 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	FMP45	Q07651	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	COQ10	Q08058	207 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MSH5	Q12175	901 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RLM1	Q12224	676 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SFG1	Q12507	346 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AAC1	P04710	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	BAR1	P12630	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ERD1	P16151	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	GPI12	P23797	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	LDB16	P25587	256 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	STP22	P25604	385 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AHC2	P25649	128 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	TIM12	P32830	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ECT1	P33412	323 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SRO77	P38163	1010 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	JLP2	P40206	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PKP1	P40530	394 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	HXT9	P40885	567 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	HXT11	P54862	567 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NUP49	Q02199	472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PFA5	Q03289	374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RSM28	Q03430	361 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	TDA1	Q03533	586 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	IPK1	Q06667	281 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SWA2	Q06677	668 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	IRC19	Q07843	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RIP1	P08067	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ERD2	P18414	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MXR2	P25566	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	GSH1	P32477	678 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
CPR4	YCR069W	SEC66	P33754	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	TPO5	P36029	618 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	NVJ1	P38881	321 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YHR210C	P38893	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	AVT6	P40074	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	STB1	P42845	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SNO4	Q04902	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	MDM30	Q05930	598 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	GRE1	Q08969	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	HSP32	Q08992	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	SPC3	Q12133	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RBD2	Q12270	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	COX9	P07255	59 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	GIT1	P25346	518 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YCR102C	P25608	368 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	VPS17	P32913	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CHK1	P38147	527 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YBR096W	P38256	230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	ECM34	P38728	170 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	FET3	P38993	636 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	BNA6	P43619	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	EFM3	P47163	339 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CCC1	P47818	322 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	TOS2	P50078	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CIK1	Q01649	594 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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