RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)O

tK(UUU)O, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)O, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)OtK(UUU)O GSH1P32477 678 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.88□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)OtK(UUU)O SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YBR138CP38277 524 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YLF2P38746 405 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RPP1P38786 293 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O MTC6P38849 526 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O CHL4P38907 458 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O ECM1P39715 212 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O BUR6P40096 142 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YNL195CP40168 261 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O MDJ2P42834 146 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O STB1P42845 420 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YFL066CP43538 392 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O IRC7P43623 340 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O FMP33P46998 180 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YJL055WP47044 245 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RMR1P53060 241 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O BRR6P53062 197 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O ERP6P53198 216 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O DAM1P53267 343 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RRN9P53437 365 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YNL165WP53891 406 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O COG5P53951 403 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RSM23Q01163 450 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O HOT1Q03213 719 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O GPI17Q04080 534 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YDL114WQ07530 308 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SRL2Q12020 392 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O TGS1Q12052 315 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SIA1Q12212 622 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O TAF3Q12297 353 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O IZH2Q12442 317 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SPS4P09937 338 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O APA2P22108 325 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O ERG4P25340 473 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SED4P25365 1065 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O UBC8P28263 218 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O TCA17P32613 152 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O CLB6P32943 380 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O MDM31P38880 579 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O MSS4P38994 779 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YER084WP40057 128 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O AAD14P42884 376 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SWP82P43554 623 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O LOH1P47055 219 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SLI1P53304 468 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O MTM1P53320 366 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O DMA2P53924 522 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O CRZ1P53968 678 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RSM28Q03430 361 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RSM24Q03976 319 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YDR391CQ04170 232 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O TAZ1Q06510 381 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YPR196WQ06595 470 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O IPK1Q06667 281 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SWA2Q06677 668 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YPR097WQ06839 1073 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O HRT1Q08273 121 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O THI72Q08579 599 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O FRE3Q08905 711 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YDL176WQ12027 708 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)OtK(UUU)O USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O GEP5Q12393 293 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)OtK(UUU)O TDH2P00358 332 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.86□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)OtK(UUU)O REP1P03871 373 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O MET3P08536 511 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O HNM1P19807 563 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O PPA2P28239 310 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O OAC1P32332 324 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O VPH2P32341 215 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O PRP21P32524 280 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O SUR1P33300 382 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O ECT1P33412 323 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YKL187CP34231 750 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O YKL107WP34251 309 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O OSH7P38755 437 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O RRG9P40156 214 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O GAT2P40209 560 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)OtK(UUU)O QDR1P40475 563 aa2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.4 ms