RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	RHB1	P25378	209 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YCR100C	P25606	316 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	PPA2	P28239	310 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	VPH2	P32341	215 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	MSN4	P33749	630 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YKL071W	P36086	256 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	APL3	P38065	1025 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YBR063C	P38083	404 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	RPP1	P38786	293 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	RBG1	P39729	369 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	not detected
YNL057W	YNL057W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	MEP3	P53390	489 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YNR064C	P53750	290 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	ASI3	P53983	676 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YKR011C	Q02209	353 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	MIM1	Q08176	113 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	SRL1	Q08673	210 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MRP10	O75012	95 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PRP28	P23394	588 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PCL1	P24867	279 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RER1	P25560	188 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	POL4	P25615	582 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YCR051W	P25631	222 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.71	□□□□□ -1.82	not detected
YNL057W	YNL057W	NUF2	P33895	451 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PRY2	P36110	329 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PSD1	P39006	500 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	IMA5	P40884	581 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MSS11	Q03825	758 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ARO10	Q06408	635 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MFG1	Q07684	458 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	IRC25	Q07951	179 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	TPK2	P06245	380 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	COQ2	P32378	372 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	GSH1	P32477	678 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ECM15	P35195	104 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YKL077W	P36081	392 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YHR035W	P38769	630 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	TAX4	P47030	604 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YGL235W	P53071	178 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	DML1	Q03652	475 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SNO4	Q04902	237 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RNH202	Q05635	350 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	HSP32	Q08992	237 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ULA1	Q12059	462 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SFM1	Q12314	213 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RAD7	P06779	565 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YAK1	P14680	807 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	CPR2	P23285	205 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ELO2	P25358	347 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YCR041W	P37265	110 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	IST2	P38250	946 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PHO90	P39535	881 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YEL068C	P39977	110 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	IRC24	P40580	263 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	DIA3	P52290	468 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	GEP7	P53171	287 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	VPS71	Q03433	280 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	BNA7	Q04066	261 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YDR391C	Q04170	232 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SFH1	Q06168	426 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RRT8	Q08219	342 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	NSL1	Q12143	216 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MRX4	Q12467	430 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MET3	P08536	511 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	DSF1	P0CX08	502 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	BOS1	P25385	244 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RPD3	P32561	433 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	NIC96	P34077	839 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YKR015C	P36111	568 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	BAP2	P38084	609 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SRO77	P38163	1010 aa		3.68	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.5 ms