RNA–Protein interactions for RNA: YLR431C

ATG23, Transcript of Peripheral membrane protein required for autophagy and CVT, yeast

Gene ATG23, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG23	YLR431C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	TPC1	P53257	314 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	KTR6	P54070	446 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	TFC7	Q12415	435 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	ZRC1	P20107	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	CYM1	P32898	989 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
ATG23	YLR431C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	MRPL10	P36520	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	SOL2	P37262	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	SHE1	P38200	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	OM14	P38325	134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	PET8	P38921	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	TIM17	P39515	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	MIG3	P39943	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	YPI1	P43587	155 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	OST6	Q03723	332 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	PHO2	P07269	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	DOA4	P32571	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	ADD37	Q03233	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	GMC1	Q04399	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	LAG2	Q92325	660 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	KRE6	P32486	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	YBR241C	P38142	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	BMT2	P38278	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	PFS1	P38872	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	MSS2	P40990	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	GAB1	P41733	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	OTU1	P43558	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	RNH201	P53942	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	KRE28	Q04431	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	PEX30	Q06169	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	MSH5	Q12175	901 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG23	YLR431C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	PRB1	P09232	635 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	CMK2	P22517	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YKL187C	P34231	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SDS24	P38314	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	EFM1	P38732	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SDS23	P53172	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	NRM1	P53718	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	TAF9	Q05027	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SFH1	Q06168	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	VPS3	P23643	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	POF1	P25576	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	ASG7	P46993	209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YNR066C	P53752	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	CDC14	Q00684	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	DPP1	Q05521	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	CTR3	Q06686	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	TLG2	Q08144	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	PER33	Q12144	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	AIM29	P36154	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	MRX3	P38172	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	WSC4	P38739	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SHC1	P39000	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	VAB2	P40003	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	STB1	P42845	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	IBA57	P47158	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	PGA2	P53903	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	AEP1	P32493	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	MEP2	P41948	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	IGD1	P43598	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	TPN1	P53099	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	LIP2	Q06005	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	MIM1	Q08176	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	VIK1	Q12045	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	HRT3	Q12347	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	IES6	P32617	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SWD3	P38123	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	CGR1	P53188	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	PEX31	P53203	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YML018C	Q03730	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	CSM4	Q08955	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	REV1	P12689	985 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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