RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCA4	YJL033W	YGR168C	P53293	376 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	BUD32	P53323	261 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MDM30	Q05930	598 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RKM5	Q12367	367 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ERP4	Q12450	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SUC2	P00724	532 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SNC1	P31109	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	KRE6	P32486	720 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PAH1	P32567	862 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	GCS1	P35197	352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SRY1	P36007	326 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ROT2	P38138	954 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YHR182W	P38870	785 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	IKI1	P38874	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	COG3	P40094	801 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YIL089W	P40500	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
HCA4	YJL033W	SNN1	P48232	102 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	DIA3	P52290	468 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RRN9	P53437	365 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ECM7	Q06200	448 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SWC7	Q06707	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SPS4	P09937	338 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
HCA4	YJL033W	PHO80	P20052	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RER1	P25560	188 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ACB1	P31787	87 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MCM10	P32354	571 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ECT1	P33412	323 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	CAF4	P36130	643 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	NVJ1	P38881	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	AIM18	P38884	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YEL028W	P39989	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	IME4	P41833	600 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PEX25	Q02969	394 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ECM30	Q06673	1274 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SNA4	Q07549	140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YOR114W	Q12219	294 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	AFI1	Q99222	893 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MOT1	P32333	1867 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YIH1	P25637	258 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YCR099C	P25657	155 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MRP20	P32387	263 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MRPL6	P32904	214 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TUL1	P36096	758 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	BMT2	P38278	337 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MBA1	P38300	278 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	COS8	P38723	381 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	AXL2	P38928	823 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TVP23	P38962	199 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	AAD10	P47182	288 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YNR061C	P53747	219 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	HXT11	P54862	567 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TOF2	Q02208	771 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TDA1	Q03533	586 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	CDC123	Q05791	360 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ASR1	Q06834	288 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	NRT1	Q08485	598 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SRL1	Q08673	210 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	REX3	Q12090	404 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MTR10	Q99189	972 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	DST1	P07273	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SPS2	P08459	502 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MET2	P08465	486 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MNE1	P24720	663 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RBK1	P25332	333 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YCR102C	P25608	368 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SYN8	P31377	255 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SSS1	P35179	80 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YFR020W	P43600	232 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MCM22	P47167	239 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	HCH1	P53834	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84

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