RNA–Protein interactions for RNA: YHR193C

EGD2, Transcript of Alpha subunit of the nascent polypeptide-associated complex (NAC), yeast

Gene EGD2, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EGD2	YHR193C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	POL4	P25615	582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	NIC96	P34077	839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	APL3	P38065	1025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	ALG14	P38242	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	IST2	P38250	946 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	RPP1	P38786	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	MTW1	P39731	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	YNR064C	P53750	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	APJ1	P53940	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	TFB3	Q03290	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	IPK1	Q06667	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	SSK1	Q07084	712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	MIM1	Q08176	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	MCT1	Q12283	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	APC2	Q12440	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EGD2	YHR193C	PDE2	P06776	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	EXO70	P19658	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YCR100C	P25606	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	NUF2	P33895	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	CTR2	P38865	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	NAS2	P40555	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	MEP3	P53390	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RNH202	Q05635	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	HRT1	Q08273	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	ATP6	P00854	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RPL39	P04650	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RAD7	P06779	565 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	MET3	P08536	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	CSM1	P25651	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	PPA2	P28239	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	MRE11	P32829	692 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
EGD2	YHR193C	GPI18	P38211	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	BNA2	P47125	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	GEP7	P53171	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	DML1	Q03652	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	SRL1	Q08673	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YPT6	Q99260	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YAK1	P14680	807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	PRP28	P23394	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RHB1	P25378	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	VPH2	P32341	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	FAT1	P38225	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	ALP1	P38971	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RCY1	P39531	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YER184C	P39961	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	FLX1	P40464	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	AGE2	P40529	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	TAX4	P47030	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	COX18	P53239	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	BNA7	Q04066	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	SNO4	Q04902	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	IRC25	Q07951	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	HSP32	Q08992	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	TSC13	Q99190	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	MSW1	P04803	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	ELO2	P25358	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	FIG1	P38224	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	PSD1	P39006	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	SWD1	P39706	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RBG1	P39729	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	IAH1	P41734	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	IRC5	P43610	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	MDE1	P47095	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	HSP31	Q04432	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	GGA1	Q06336	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	THP1	Q08231	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	MRX4	Q12467	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	RER1	P25560	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EGD2	YHR193C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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