RNA–Protein interactions for RNA: YHR140W

YHR140W, Transcript of Putative integral membrane protein of unknown function, yeast

Gene YHR140W, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR140W	YHR140W	YFR057W	P43625	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	CRH1	P53301	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	BIO4	P53630	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	TRM82	Q03774	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	BCP1	Q06338	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	DDC1	Q08949	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	FRE8	Q12209	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	SIA1	Q12212	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	RPN6	Q12377	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	IZH2	Q12442	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	YNL320W	P42840	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	BIR1	P47134	954 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	BNS1	P50084	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	YGR266W	P53326	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	HCH1	P53834	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	SAL1	D6W196	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	PET123	P17558	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	COT1	P32798	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	ZRT1	P32804	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	MRX3	P38172	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	MOB1	P40484	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	REE1	P40893	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	COX16	P47081	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	CLD1	P53264	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	TEL1	P38110	2787 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YHR140W	YHR140W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	CKA2	P19454	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	RPB5	P20434	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	PMT2	P31382	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	MEI5	P32489	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	RCK2	P38623	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	RCY1	P39531	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SLM1	P40485	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	FMP33	P46998	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	BOR1	P53838	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	COX4	P04037	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SPS100	P13130	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	HMT1	P38074	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	ATG18	P43601	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SHE10	P53075	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	ATC1	Q04005	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	IRC25	Q07951	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	IES4	Q08561	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	FDH1	Q08911	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	MCT1	Q12283	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	HAP2	P06774	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	HIS2	P38635	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	RTC4	P53850	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	PGA2	P53903	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	APC9	Q12107	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	ATP16	Q12165	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	JID1	Q12350	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	HMS1	Q12398	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	REP1	P03871	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	CPR3	P25719	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	MRPL10	P36520	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	YER186C	P40101	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	KEL2	P50090	882 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SUR7	P54003	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SPP2	Q02521	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	FSH2	Q05015	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	GAS2	Q06135	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SIP3	P38717	1229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	CTM1	P38818	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	YGR210C	P42942	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	AGX1	P43567	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	SED5	Q01590	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	TAF10	Q12030	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	YSR3	P23501	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	YHR035W	P38769	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	PEX22	P39718	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	OXA1	P39952	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHR140W	YHR140W	MEP2	P41948	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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