RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	TPO3	Q06451	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	HMS1	Q12398	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	IZH2	Q12442	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YPK2	P18961	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MET28	P40573	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MRM2	P53123	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	APJ1	P53940	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MMT1	Q03218	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SNC1	P31109	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MSN4	P33749	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	CLG1	P35190	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	PRY2	P36110	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SYF2	YGR129W	BRR6	P53062	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	FAR8	Q05040	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	CTS2	Q06350	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SSK1	Q07084	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SYO1	Q07395	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ARG3	P05150	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	CCA1	P21269	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	CTR2	P38865	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YIL166C	P40445	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	AGE2	P40529	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
SYF2	YGR129W	SNM1	P40993	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YGR201C	P42936	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	BUL1	P48524	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YDL186W	P48568	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SPO77	Q06134	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	DEP1	P31385	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RPC82	P32349	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	JEN1	P36035	616 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RPP1	P38786	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	BUR6	P40096	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	IRC7	P43623	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	NUP57	P48837	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YGL235W	P53071	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YNR062C	P53748	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YML122C	Q03207	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	TIM9	O74700	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ELO2	P25358	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YCR100C	P25606	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	POL4	P25615	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	ECM15	P35195	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YNR064C	P53750	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YNL181W	P53878	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	IPK1	Q06667	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MFG1	Q07684	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	SRL1	Q08673	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	MCT1	Q12283	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	NCA2	Q12374	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RPL39	P04650	51 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YAK1	P14680	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YKL071W	P36086	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RBG1	P39729	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	YEL068C	P39977	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYF2	YGR129W	VPS71	Q03433	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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