RNA–Protein interactions for RNA: YGL195W

GCN1, Transcript of Positive regulator of the Gcn2p kinase activity, yeast

Gene GCN1, Length 8,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN1	YGL195W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YEL057C	P39983	233 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	TIS11	P47977	285 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YOR365C	Q08844	703 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	MRPL33	P20084	86 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	MSB2	P32334	1306 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	DCW1	P36091	449 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YBR071W	P38243	211 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	SNM1	P40993	198 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YNR062C	P53748	327 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	DOA4	P32571	926 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	STE14	P32584	239 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	SRY1	P36007	326 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	ROY1	Q04847	553 aa		3	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RIF1	P29539	1916 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	AI4	P03878	556 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	THI80	P35202	319 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	TRR2	P38816	342 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	QRI7	P43122	407 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	COX16	P47081	118 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	IBA57	P47158	497 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	FLC3	P53121	802 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YPL062W	Q02781	134 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	EKI1	Q03764	534 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RNH202	Q05635	350 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PSF1	Q12488	208 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	SPO7	P18410	259 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	GPX1	P36014	167 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	KAE1	P36132	386 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	ECM31	P38122	312 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	IRC24	P40580	263 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YDL176W	Q12027	708 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	URA6	P15700	204 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	LDS1	P31379	325 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PPQ1	P32945	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	SLG1	P54867	378 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PFA5	Q03289	374 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PUS5	Q06244	254 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	SUL2	Q12325	893 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PRB1	P09232	635 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	THI4	P32318	326 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	TRS65	P32893	560 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YHR180W	P38868	163 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	FMP52	P40008	231 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	SLZ1	P40167	298 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YIR007W	P40566	764 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	COQ5	P49017	307 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PHO23	P50947	330 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	GMC1	Q04399	608 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YDL177C	Q12257	170 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YPK2	P18961	677 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	SCS3	P53012	380 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	DAD3	P69850	94 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	MRP51	Q02950	344 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	GIC2	Q06648	383 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	ACH1	P32316	526 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	FMP10	P40098	244 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	POG1	P40473	351 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	OST6	Q03723	332 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YDL129W	Q07555	291 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	AEP3	Q12089	606 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PPZ2	P33329	710 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	ECT1	P33412	323 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	MNL1	P38888	796 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	NSE4	P43124	402 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YGR012W	P53206	393 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	YGR026W	P53217	278 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RNH1	Q04740	348 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GCN1	YGL195W	RSC58	Q07979	502 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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