RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W CPR3P25719 182 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W NAM9P27929 486 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PUP2P32379 260 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data7.96□□□□□ -1.14not detected
DDI1YER143W ZRT3P34240 503 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YKR073CP36153 106 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W CHK1P38147 527 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YIL165CP40446 119 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W FMC1P40491 155 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PAM16P42949 149 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YDR209CQ03480 137 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SCS7Q03529 384 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W NUP53Q03790 475 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W HLR1Q04429 423 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W IRC19Q07843 230 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W HNT3Q08702 217 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SOG2Q08817 791 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W FRE6Q12473 712 aa7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RPN13O13563 156 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PDE2P06776 526 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W HMG1P12683 1054 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W CTA1P15202 515 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data7.95□□□□□ -1.14not detected
DDI1YER143W SFH5P47008 294 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SAM37P50110 327 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W IMO32P53219 342 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PAU12P53343 120 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W GRE1Q08969 168 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MDM32Q12171 622 aa7.95□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SIR2P06700 562 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PEP4P07267 405 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YGL041W-AP0C5N3 154 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YCR102CP25608 368 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PPA2P28239 310 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RSM22P36056 628 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PAU24P38155 120 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W VBA2P38358 474 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SOH1P38633 127 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YHK8P38776 514 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PTH1P38876 190 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PMT6P42934 759 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W ECO1P43605 281 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W ECL1P48235 211 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W BRR6P53062 197 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RAI1P53063 387 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W VOA1P53262 265 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YGR126WP53274 230 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SAY1P53324 424 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W ATG4P53867 494 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MSS11Q03825 758 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W TOR1P35169 2470 aa7.94□□□□□ -1.14
DDI1YER143W OPI3P05375 206 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YHR214C-DP0CX93 97 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W EXG1P23776 448 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SDS22P36047 338 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W CHS7P38843 316 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PHO90P39535 881 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W FCY21P40039 528 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YDR514CQ04408 483 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YMR252CQ04814 134 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MRPL35Q06678 367 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W BRE4Q07660 1125 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YPL278CQ08990 100 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RCN2Q12044 265 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W FLO9P39712 1322 aa7.93□□□□□ -1.14
DDI1YER143W ERG8P24521 451 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W AHC2P25649 128 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W FUN26P31381 517 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YBR063CP38083 404 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YER184CP39961 794 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SDP1P40479 209 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W REE1P40893 198 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W POP1P41812 875 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MRH4P53166 561 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W NUP116Q02630 1113 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W AIM6Q07716 390 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PEX27Q08580 376 aa7.92□□□□□ -1.14
DDI1YER143W COX9P07255 59 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MRP1P10662 321 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SEC62P21825 274 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W NFS1P25374 497 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W BOS1P25385 244 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W THI4P32318 326 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W DOA4P32571 926 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W NPL6P32832 435 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W VPS17P32913 551 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MBA1P38300 278 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RFC4P40339 323 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.7 ms