RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeastyeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDR2YOL052C-A FDC1Q03034 503 aa9.86□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A CGI121Q03705 181 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A GPI17Q04080 534 aa9.86□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A ACF2Q12168 779 aa9.86□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A YOL114CQ12322 202 aa9.86□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A YCL002CP25565 263 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A AHC2P25649 128 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A MAL32P38158 584 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A YJL218WP40892 196 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A SFH5P47008 294 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A MAL12P53341 584 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A RSM10Q03201 203 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A PFA5Q03289 374 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A DFG5Q05031 458 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A YDL176WQ12027 708 aa9.85□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A PRE7P23724 241 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A FUN19P28003 413 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data9.84□□□□□ -0.83not detected
DDR2YOL052C-A PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data9.84□□□□□ -0.83 RIP-Chip
DDR2YOL052C-A SEF1P34228 1148 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A DTR1P38125 572 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A PHO90P39535 881 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A YIL165CP40446 119 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A PKP1P40530 394 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A VNX1P42839 908 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A MKC7P53379 596 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A TAZ1Q06510 381 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A NGL1Q08213 363 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A RDR1Q08904 546 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A FRE5Q08908 694 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A BTS1Q12051 335 aa9.84□□□□□ -0.83
DDR2YOL052C-A RPN13O13563 156 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A LDB16P25587 256 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A RSM22P36056 628 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A CHK1P38147 527 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A YER158CP40095 573 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SNX41Q04053 625 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A IRC19Q07843 230 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A HRT1Q08273 121 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A RAX1Q08760 435 aa9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A YRA1Q12159 226 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A CDC31P06704 161 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A PEP4P07267 405 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A HMG1P12683 1054 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A RPB8P20436 146 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A RAD51P25454 400 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A FUN26P31381 517 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data9.82□□□□□ -0.84not detected
DDR2YOL052C-A SDS22P36047 338 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A MRPL16P38064 232 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A FCY21P40039 528 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SDP1P40479 209 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A PAU12P53343 120 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A ATG21Q02887 496 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A NUP53Q03790 475 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A GPN3Q06543 272 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A FRE6Q12473 712 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A YOR343CQ12484 108 aa9.82□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A QCR7P00128 127 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A NFT1P0CE68 1218 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A GAS1P22146 559 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SCO1P23833 295 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A ERG8P24521 451 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A NUP116Q02630 1113 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SCS7Q03529 384 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A TDA1Q03533 586 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A COX20Q04935 205 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A AIM6Q07716 390 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A YPR1Q12458 312 aa9.81□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A IRA2P19158 3079 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SIR2P06700 562 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A YHR214C-DP0CX93 97 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A EXG1P23776 448 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SBA1P28707 216 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A NPL6P32832 435 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A VPS17P32913 551 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A THI2P38141 450 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A PAU24P38155 120 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A OM14P38325 134 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A RTT105P40063 208 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A POP1P41812 875 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A PGU1P47180 361 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A IMD3P50095 523 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A RAI1P53063 387 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A IMO32P53219 342 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A VOA1P53262 265 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SFG1Q12507 346 aa9.8□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A COX9P07255 59 aa9.79□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A YCR102CP25608 368 aa9.79□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A DOA4P32571 926 aa9.79□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A CCZ1P38273 704 aa9.79□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A MBA1P38300 278 aa9.79□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data9.79□□□□□ -0.84not detected
DDR2YOL052C-A YER010CP40011 234 aa9.79□□□□□ -0.84
DDR2YOL052C-A SER3P40054 469 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.5 ms