RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	YHL044W	P38727	235 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	SMP3	Q04174	516 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	SUE1	Q06524	206 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	1.07	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	HIS3	P06633	220 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	FCY21	P40039	528 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	MIG2	P53035	382 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	PRR2	Q12310	699 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	CKI1	P20485	582 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	GRR1	P24814	1151 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	YJR146W	P47174	117 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	NAT4	Q04751	285 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	ERG9	P29704	444 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	CIK1	Q01649	594 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	SUR1	P33300	382 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	BUD2	P33314	1104 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	MPS2	P53159	387 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	OSH6	Q02201	448 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	APC5	Q08683	685 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	PRM4	Q12498	284 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.24
VAR1	Q0140	UTR1	P21373	530 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	HCH1	P53834	153 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	REP1	P03871	373 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	MXR2	P25566	168 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	VPH2	P32341	215 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	AIM29	P36154	155 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	YNR066C	P53752	436 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	SPO77	Q06134	477 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	MMS21	P38632	267 aa		1	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	RSM27	P53305	110 aa		1	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	BIO4	P53630	237 aa		1	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	SPC19	Q03954	165 aa		1	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	GYL1	Q04322	720 aa		1	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	RAD1	P06777	1100 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
VAR1	Q0140	IML3	P38265	245 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	SPS100	P13130	326 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	SYS1	P41544	203 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	YFH1	Q07540	174 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VAR1	Q0140	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	PET8	P38921	284 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	PES4	P39684	611 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	EFM4	P40516	257 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	YHC3	P47040	408 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	YGR266W	P53326	701 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	YOR292C	Q08743	309 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	VIK1	Q12045	647 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	YPL150W	Q12152	901 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	SFG1	Q12507	346 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	DCC1	P25559	380 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	COS6	P53344	381 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	SLM2	P53955	656 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	EMC6	Q12431	108 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	COY1	P34237	679 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	PEX32	P38292	413 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	YHR045W	P38775	560 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	GLE1	Q12315	538 aa		0.94	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	MLC1	P53141	149 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	CTS2	Q06350	511 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	AGC1	Q12482	902 aa		0.93	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	MAS1	P10507	462 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	MRPL6	P32904	214 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	MND1	P53102	219 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	LIF1	P53150	421 aa		0.92	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	YFL064C	P43540	174 aa		0.91	□□□□□ -2.26
VAR1	Q0140	HMX1	P32339	317 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	YMR134W	P40207	237 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	NNT1	Q05874	261 aa		0.9	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	MEI5	P32489	222 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	MBA1	P38300	278 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	SMC6	Q12749	1114 aa		0.89	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	YHR122W	P38829	231 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	YIL012W	P40551	113 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	TVP15	Q03860	143 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	YPL278C	Q08990	100 aa		0.88	□□□□□ -2.27
VAR1	Q0140	BOL1	Q3E793	110 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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