RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 APBB2Q92870 758 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 TIGD1Q96MW7 591 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 DACT1Q9NYF0 836 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SIP14410 1827 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 K7ENM7 598 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC16A4O15374 487 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRAK2O60296 914 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CXCL10P02778 98 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CASP1P29466 404 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF131P52739 623 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 EFNA5P52803 228 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CUL4BQ13620 913 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM228AQ86W67 206 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SFR1Q86XK3 245 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PADI3Q9ULW8 664 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 K7ERI5 159 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 FGBP02675 491 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 FGFR4P22455 802 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCD1P33897 745 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MCM4P33991 863 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 STRN3Q13033 797 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 IKBKEQ14164 716 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 POSTNQ15063 836 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAPK6Q16659 721 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 UNC13DQ70J99 1090 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 EXOC1Q9NV70 894 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEP290O15078 2479 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 DENND3A2RUS2 1198 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZBBXA8MT70 800 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 EFCAB14O75071 495 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMC2O95347 1197 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MBD3O95983 291 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRKCBP05771 671 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTMSP20962 102 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 SCP2P22307 547 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 COASYQ13057 564 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 GPNMBQ14956 572 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF365Q70YC5 407 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 GCNT3O95395 438 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRR29P0C7W0 189 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 KCNJ6P48051 423 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 EPHB4P54760 987 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 NCKAP1LP55160 1127 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM240Q5SV17 173 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 20.4
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 TET1Q8NFU7 2136 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ACKR2O00590 384 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 BAIAP3O94812 1187 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms