RNA–Protein interactions for RNA: YNL339W-B

YNL339W-B, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNL339W-B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL339W-B	YNL339W-B	MDM32	Q12171	622 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL339W-B	YNL339W-B	YOL114C	Q12322	202 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL339W-B	YNL339W-B	APC2	Q12440	853 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL339W-B	YNL339W-B	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL339W-B	YNL339W-B	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	CMP2	P14747	604 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	PHO80	P20052	293 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RPB5	P20434	215 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	AGP1	P25376	633 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ERG9	P29704	444 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	NIC96	P34077	839 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MRPL3	P36516	390 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MRPL37	P36532	105 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SRO77	P38163	1010 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	TAE1	P38340	232 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	CHL4	P38907	458 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
YNL339W-B	YNL339W-B	MET30	P39014	640 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	VMA7	P39111	118 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MDE1	P47095	244 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	AAD10	P47182	288 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SGF73	P53165	657 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	IMO32	P53219	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MEP3	P53390	489 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
YNL339W-B	YNL339W-B	YKR011C	Q02209	353 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MSC1	Q03104	513 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ROT1	Q03691	256 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	OST6	Q03723	332 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SPC19	Q03954	165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	PLM2	Q04383	521 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YLR283W	Q05867	314 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	OPI10	Q08202	246 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RAX1	Q08760	435 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	FRE5	Q08908	694 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	FDH1	Q08911	376 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YOR114W	Q12219	294 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	TPO4	Q12256	659 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SKS1	Q12505	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MTR10	Q99189	972 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SPS2	P08459	502 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	STE12	P13574	688 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	CBS1	P14066	229 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	OAR1	P35731	278 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	JEN1	P36035	616 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	NAT2	P37293	288 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MED6	P38782	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MBP1	P39678	833 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	HPA3	P39979	161 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	HXT9	P40885	567 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RPE1	P46969	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ERV29	P53337	310 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YMR130W	Q04223	302 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	TPO3	Q06451	622 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YEH1	Q07804	573 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YOR214C	Q12282	236 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ATG31	Q12421	196 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	MPD2	Q99316	277 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	CAN1	P04817	590 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ITR1	P30605	584 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SNC1	P31109	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	FUN26	P31381	517 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RNP1	P32385	249 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ORC2	P32833	620 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	RPC34	P32910	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	SFC1	P33303	322 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ECT1	P33412	323 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ECM15	P35195	104 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	IFA38	P38286	347 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	ALP1	P38971	573 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	YEL068C	P39977	110 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL339W-B	YNL339W-B	PHM8	P40025	321 aa		4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.7 ms