RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	TIM9	O74700	87 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SIR3	P06701	978 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YPK2	P18961	677 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RER1	P25560	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PEX3	P28795	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
MRP17	YKL003C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	TIM12	P32830	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MDL1	P33310	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MRPL39	P36533	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YHL012W	P38709	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MAM33	P40513	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	GET1	P53192	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	UGO1	Q03327	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SCS7	Q03529	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RLM1	Q12224	676 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SFM1	Q12314	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SET6	Q12529	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MET2	P08465	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MSS18	P08593	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	CMK2	P22517	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RHB1	P25378	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ITR2	P30606	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YKL187C	P34231	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ECM15	P35195	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SRO77	P38163	1010 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ARN2	P38724	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RPP1	P38786	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PEX18	P38855	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ALP1	P38971	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	COG3	P40094	801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	IDP2	P41939	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YGL235W	P53071	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PCP1	P53259	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	DAM1	P53267	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	DMA2	P53924	522 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MRP51	Q02950	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ACL4	Q03771	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	BCP1	Q06338	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SWA2	Q06677	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	IRC19	Q07843	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	NTG2	Q08214	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	VMA3	P25515	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	NTG1	P31378	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YKL077W	P36081	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RCY1	P39531	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	KRE29	P40026	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YIL165C	P40446	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	AVT7	P40501	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	IRC7	P43623	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	TOM22	P49334	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YNR062C	P53748	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RSM24	Q03976	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PEX12	Q04370	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	GTB1	Q04924	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SYO1	Q07395	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MRPL33	P20084	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MCM10	P32354	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SLC1	P33333	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	NUF2	P33895	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RSM22	P36056	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	CHK1	P38147	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MAL32	P38158	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SWD1	P39706	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	COQ10	Q08058	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	HRT1	Q08273	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ULA1	Q12059	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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