RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 GPATCH11Q8N954 259 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TTC25Q96NG3 672 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 VCPKMTQ9H867 229 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GUA9 196 aa6.93□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 ECE1P42892 770 aa6.93□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 SNX1Q13596 522 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TTC1Q99614 292 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 F8W8V4 182 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ATP1A2P50993 1020 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EXOC4Q96A65 974 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA33Q96N06 139 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 LRRD1A4D1F6 860 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAM187AA6NFU0 413 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ACTN1P12814 892 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TFDP2Q14188 446 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PLCB4Q15147 1175 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN21Q16825 1174 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 MICALL2Q8IY33 904 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EHD4Q9H223 541 aa6.93□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 BCL9O00512 1426 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFB10O96000 172 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SRGNP10124 158 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 HOXD10P28358 340 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CXCR5P32302 372 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SLC1A1P43005 524 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CLCN6P51797 869 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CYP27A1Q02318 531 aa6.93□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.93□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 CCDC160A6NGH7 325 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 DGAT1O75907 488 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A27O95847 323 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FGGP02679 453 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PLS3P13797 630 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNA3P32297 505 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SLC8A1P32418 973 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PCK1P35558 622 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 OSTNP61366 133 aa6.92□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 CHST13Q8NET6 341 aa6.92□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 COX16Q9P0S2 106 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.92□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 CHRNA5P30532 468 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GCLMP48507 274 aa6.92□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 XKR3Q5GH77 459 aa6.92□□□□□ -1.3
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PDE4D-228ENST00000636120 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CALN1Q9BXU9 219 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP12Q02952 1782 aa6.92□□□□□ -1.3
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