RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-215ENST00000589485 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.05■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 PDCP20941 246 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 GPM6BQ13491 265 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 FERMT3Q86UX7 667 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 DACT1Q9NYF0 836 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 STK24Q9Y6E0 443 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 PRPHP41219 470 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 FAM189BP81408 668 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 PDIA5Q14554 519 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 RNF149Q8NC42 400 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 RNF169Q8NCN4 708 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 CHST12Q9NRB3 414 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 H3BNC9 293 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 BMPR1AP36894 532 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 PHKA2P46019 1235 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 TFDP1Q14186 410 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-215ENST00000589485 HOXA2O43364 376 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 RB1P06400 928 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 FGFR1P11362 822 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 MUTP22033 750 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PTPROQ16827 1216 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 KRT79Q5XKE5 535 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 BRAPQ7Z569 592 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ABI1Q8IZP0 508 aa23■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 MCPH1Q8NEM0 835 aa23■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ASAP3Q8TDY4 903 aa23■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.99■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ARL2P36404 184 aa22.99■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.99■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 THEGQ9P2T0 379 aa22.99■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 A0A0U1RQF3 1178 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PP2D1A8MPX8 630 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ERLIN2O94905 339 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 EOMESO95936 686 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 LINC00271P0C7V0 271 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 CAPSQ13938 189 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 IL17AQ16552 155 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ECM1Q16610 540 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PADI6Q6TGC4 694 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 HSCBQ8IWL3 235 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PLVAPQ9BX97 442 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 AAASQ9NRG9 546 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.98■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 SKIP12755 728 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 GLRA2P23416 452 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 CDC25AP30304 524 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PTENP60484 403 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.97■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 SYT1P21579 422 aa22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 RAB27AP51159 221 aa22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 SNX21Q969T3 373 aa22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 DNM3Q9UQ16 869 aa22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.96■■□□□ 1.27
ILF3-215ENST00000589485 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms