RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410497.1

RNU6-955P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 955, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-955P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-955P-201ENST00000410497 ANXA13P27216 316 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 HOXD10P28358 340 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 CRABP2P29373 138 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SERPINB3P29508 390 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PPP2R1AP30153 589 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NMT1P30419 496 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 CIITAP33076 1130 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 MCM7P33993 719 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 HOXD12P35452 270 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SLC16A2P36021 539 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 HSD17B2P37059 387 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SPAM1P38567 509 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 UBA7P41226 1012 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PPP1R2P41236 205 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 STAT1P42224 750 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 HALP42357 657 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PAFAH1B1P43034 410 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 MAGEA2P43356 314 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ABCG1P45844 678 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ATP5OP48047 213 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SLC9A3P48764 834 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 RGS19P49795 217 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 RGS7P49802 495 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SCNN1BP51168 640 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 GPC3P51654 580 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 USP11P51784 963 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 CASP5P51878 434 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NEK3P51956 506 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PGDP52209 483 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 LIMK1P53667 647 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ATP12AP54707 1039 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PTPN5P54829 565 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SEC13P55735 322 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NUP107P57740 925 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 EVA1CP58658 441 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NLRP6P59044 892 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NLRP12P59046 1061 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PSMC6P62333 389 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 GNGT1P63211 74 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ATP8B2P98198 1209 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NFKB2Q00653 900 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 BNC1Q01954 994 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PLCB3Q01970 1234 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 GUCY1A3Q02108 690 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PUDPQ08623 228 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NIPAL4Q0D2K0 466 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 KLHL30Q0D2K2 578 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 MYO1EQ12965 1108 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 USP4Q13107 963 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NR5A1Q13285 461 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ART3Q13508 389 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 EFR3AQ14156 821 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 GNA13Q14344 377 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PDE3AQ14432 1141 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 GALNT3Q14435 633 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SMCO1Q147U7 214 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 CLCA4Q14CN2 919 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 EMC2Q15006 297 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 MORF4L2Q15014 288 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NCF4Q15080 339 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 CYTH1Q15438 398 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SPA17Q15506 151 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 STK11Q15831 433 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ADRM1Q16186 407 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SSX2Q16385 188 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 INSCQ1MX18 579 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 TRIM16LQ309B1 348 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ZNF792Q3KQV3 632 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 TBC1D25Q3MII6 688 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ARL13BQ3SXY8 428 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 KMT5BQ4FZB7 885 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 MINDY4Q4G0A6 757 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 CCDC58Q4VC31 144 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 EPC2Q52LR7 807 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 FBXO48Q5FWF7 155 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 XKR9Q5GH70 373 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 HES5Q5TA89 166 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 METTL11BQ5VVY1 283 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 FYB2Q5VWT5 728 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 KRT79Q5XKE5 535 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 FBXW10Q5XX13 1052 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PCNX4Q63HM2 1172 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ATG16L1Q676U5 607 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 OLFML2BQ68BL8 750 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 ANKS6Q68DC2 871 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 FCRLBQ6BAA4 426 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 SULT1C3Q6IMI6 304 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-955P-201ENST00000410497 PYHIN1Q6K0P9 492 aa1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.4 ms