RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C OPT2Q06593 877 aa4.08□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C SRF1Q12516 437 aa4.08□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C RPN1P38764 993 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C CSN12P47130 423 aa4.07□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C GLY1P37303 387 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C YBL086CP38177 466 aa4.06□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C KIN1P13185 1064 aa4.05□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C EMW1P42842 904 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C ARG82P07250 355 aa4.04□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C MIP1P15801 1254 aa4.03□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C ARG8P18544 423 aa4.03□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C TY1A-BLQ12266 440 aa4.03□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C AAD14P42884 376 aa4.03□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C CAF120P53836 1060 aa4.03□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C FIG4P42837 879 aa4.02□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C SCW11P53189 542 aa4.02□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data4.02□□□□□ -1.77not detected
HDA3YPR179C UBP2Q01476 1272 aa4.02□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C SSA2P10592 639 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C LSC2P53312 427 aa4.02□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C RAD59Q12223 238 aa4.02□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C YJR098CP47139 656 aa4□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C APP1P53933 587 aa4□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C GUA1P38625 525 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C YIR007WP40566 764 aa3.99□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C YPR084WQ06821 456 aa3.99□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C TEC1P18412 486 aa3.98□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C TRK2P28584 889 aa3.98□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C NAF1P53919 492 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C HPC2Q01448 625 aa3.98□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C MKS1P34072 584 aa3.97□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C ITT1Q04638 464 aa3.97□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C HPF1Q05164 967 aa3.97□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C STE6P12866 1290 aa3.96□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C FBP26P32604 452 aa3.96□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C OSH7P38755 437 aa3.96□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C YGR035CP53222 116 aa3.96□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C TCB1Q12466 1186 aa3.96□□□□□ -1.77
HDA3YPR179C BDS1Q08347 646 aa3.96□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C GUT2P32191 649 aa3.95□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C DLD1P32891 587 aa3.95□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C CSE4P36012 229 aa3.95□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C VTC4P47075 721 aa3.95□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C TY1A-MR1Q04215 440 aa3.94□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C DFG5Q05031 458 aa3.94□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C FRA1Q07825 749 aa3.94□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C ROG3P43602 733 aa3.94□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C DPH6Q12429 685 aa3.94□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C ISU1Q03020 165 aa3.93□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C MRX12P47084 519 aa3.93□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C STE20Q03497 939 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C CCP1P00431 361 aa3.92□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C RPP2BP02400 110 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C LYS5P50113 272 aa3.92□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C ATG20Q07528 640 aa3.92□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C YPR204WQ08995 1032 aa3.92□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C LSB3P43603 459 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C DAL1P32375 460 aa3.91□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C APL6P46682 809 aa3.91□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C TFB3Q03290 321 aa3.91□□□□□ -1.78
HDA3YPR179C CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C PKC1P24583 1151 aa3.89□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C ICP55P40051 511 aa3.89□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C BRL1P38770 471 aa3.88□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C JJJ3P47138 172 aa3.88□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C LEO1P38439 464 aa3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C MSN5P52918 1224 aa3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C SPT2P06843 333 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C SUP45P12385 437 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C BIO2P32451 375 aa3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C YBL036CP38197 257 aa3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C MCM16Q12262 181 aa3.87□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C EMP47P43555 445 aa3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C SSN3P39073 555 aa3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C UBP15P50101 1230 aa3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C ISR1Q06098 443 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C WTM2Q12206 467 aa3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C PHM7Q12252 991 aa3.85□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C SLA1P32790 1244 aa3.84□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C YPP1P46951 817 aa3.84□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C CUZ1P53899 274 aa3.84□□□□□ -1.79
HDA3YPR179C ATG3P40344 310 aa3.83□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C DIT1P21623 536 aa3.82□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C ISF1P32488 338 aa3.82□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C UTR2P32623 467 aa3.82□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C CEM1P39525 442 aa3.82□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C RIM21P48565 533 aa3.82□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.82□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C ENO2P00925 437 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C DAT1P13483 248 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C TBS1P38114 1094 aa3.81□□□□□ -1.8
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